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 Papillon: pacchetto python per plot RNA-seq
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Tag   RNA-seq    Galaxy    python  Aggiungi Tag

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domi84
Moderatore

Smile3D
Cittā: Glasgow


1547 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2017 : 00:29:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti.
Se avete fatto una RNA-seq con Galaxy/cuffdiff normalmente potete esplorare i geni usando cummeRbund.
Non conoscendo R ho preferito scrivere un modulo in python: Papillon.
Sul sito https://github.com/domenico-somma/Papillon e' presente il manuale e un tutorial. Siccome e' su pypi si installa facilmente con un
pip install papillon

Se a qualcuno andasse di provarlo, qualsiasi feedback qui o sul sito github e' ben accetto.

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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