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eMarco95
Nuovo Arrivato



2 Messaggi

Inserito il - 14 settembre 2018 : 16:11:34  Mostra Profilo Invia a eMarco95 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno ragazzi,
Sto studiando un articolo per un esame di biologia molecolare che devo dare a breve. Nel articolo in sostanza, dimostrano una correlazione tra un incremento dei livelli di ROS durante la fase di crescita esponenziale (in lievito), ed un aumento del cronological life span.
Tra i vari esperimenti che fanno vi è una ChIP sulle regioni subtelomeriche, che porta a dimostrare che la fosforilazione di una proteina (RPH1), causa un aumento della metilazione del H3K36.
Ora, nell'immagine, che allego, normalizzano i dati su i livelli di istone H3. Non riesco molto a capire che tipo di normalizzazione abbiano fatto e perchè nelle varie condizioni immunoprecipitano %input diverse di H3.


Immagine:

55,26 KB

Vi allego il link dell'articolo se siete interessati
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3694503/

Grazie delle risposte!!

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1633 Messaggi

Inserito il - 14 settembre 2018 : 20:07:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Premetto che non ho nessuna eperienza di ChIP di istoni. La normalizzazione fatta è una semplice divisione del segnale di H3K36me per il segnale di H3. In questo modo normalizzi per le diverse quantità di input.
Es.
Vuoi sapere quanti alunni portano l'orologio in due classi, in una ci sono 30 alunni nell'altra 25. Nella prima 8 hanno l'orologio, nella seconda 5.
8/30= 0.27
5/25= 0.2
hai normalizzato e puoi comparare.

Concordo che la quantità di input dovrebbe essere la stessa per tutti i campioni e non so perchè vari, ma di sicuro questa normalizzazione è un buon modo per tenerlo sotto controllo.

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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eMarco95
Nuovo Arrivato



2 Messaggi

Inserito il - 16 settembre 2018 : 09:12:19  Mostra Profilo Invia a eMarco95 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie mille!!
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