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Autore Discussione  

dabar
Nuovo Arrivato


Prov.: Catania
Cittā: Catania


30 Messaggi
Inserito il - 20 aprile 2007 : 00:19:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dabar  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dabar Invia a dabar un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti.
Scusate, io ho un problema.
Data una lista di geni (gene symbol) vorrei sapere quale sia (o quali siano) la loro funzione biologica e, di preferenza, vorrei un programma che mi raggruppasse in gruppi omogenei i geni che hanno uguale funzione.
Esiste in GO o da qualche altra parte e se si, quale?


Grazie.
Davide

Marianna
Utente Junior




146 Messaggi
Inserito il - 20 aprile 2007 : 18:54:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Vai in pubmed, seleziona "gene" digita il nome del gene che ti interessa ed avvia la ricerca..ti escono tutte le caratteristiche del gene in questione e tra le varie c'č proprio scritto geneontology..puoi trovare li un riassunto delle funzioni del gene.
Farah
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Schuldiner86
Utente Junior

Biotech

Prov.: Viterbo
Cittā: Bologna


581 Messaggi
Inserito il - 20 aprile 2007 : 19:49:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Schuldiner86  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Schuldiner86  Invia a Schuldiner86 un messaggio Yahoo! Invia a Schuldiner86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Secondo me per la funzione biologica ti conviene usare Swiss-Prot all'indirizzo www.expasy.org/uniprot che ti dā parecchie informazioni sul peptide codificato dal gene...


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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 03 maggio 2007 : 20:55:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Un buon tool per lavorare sulle ontologie é Babelomics: http://babelomics.org/

C'é scritto che serve per confrontare due liste di geni, ma credo funzioni anche con una alla volta.
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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mattions
Nuovo Arrivato




3 Messaggi
Inserito il - 04 maggio 2007 : 16:43:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mattions Invia a mattions un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ebimed non č male ;)
http://www.ebi.ac.uk/Rebholz-srv/ebimed/index.jsp
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