[PYTHON] Equaz Michaelis-Menden per una rete proteica

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Genetica. Principi di analisi formale
Autori Vari

Fondamenti di biochimica
Peck Ritter

Il gene VI
Benjamin Lewin

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

Laboratorio

Bioinformatica e Biostatistica

[PYTHON] Equaz Michaelis-Menden per una rete proteica

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

mikkc
Nuovo Arrivato

11 Messaggi

Inserito il - 28 aprile 2020 : 02:16:36

Ho realizzato un elaborato in python sullo studio/analisi e ricostuzione di una rete di interazione proteica.

A questo punto devo inserire la seconda parte di corso in cui vengono trattati:
- equazione di Michaelis-Menten
- equazione di Hill

Considerato che non ho modo di rilevare dati in laboratorio, e di aver scaricato un file di interazione proteica dal sito consigliato dal prof,

1) come posso calcolare le equazione?
2) ci sono dati ottenuti dall'analisi del network, per ciascuna proteina, utile per il calcolo?
3) come mi consigliate procedere?

PS: studiando un po qua e la ho trovato che i valori km e Vmax sono difficili da reperire e che consigliano il piano di Lineweaver e Burk per ottenerli mediante l'interpolazione dei dati con regressione lineare.
Appurato che ho gia l'istruzione python, quali dati devo analizzare?

Grazie 1000!

mikkc
Nuovo Arrivato

11 Messaggi

Inserito il - 30 aprile 2020 : 23:31:41

Proseguendo con lo studio... le proteine di cui sto analizzando il network sono kinasi, quindi multienzimi,
per cui la funzione cinetica da considerare � la funzione di Hill e NON di i Michaelis-Menten.

La interazione proteina-proteina pu� modificare le costanti cinetiche di un enzima.

Come?

Grazie!