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Autore Discussione  

volley
Nuovo Arrivato

Prov.: Pisa
Città: pontedera


3 Messaggi
Inserito il - 08 giugno 2007 : 10:21:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di volley Invia a volley un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti,
prox iniziero ad usare la tecnica della real time,,,
volevo sapere quali programmi sono maggiormente utilizzati per costruire i primer per l'utilizzo dell syber green

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 08 giugno 2007 : 23:40:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Come ti dicevo qui: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=3836
basta usare primer 3

Trovi un esempio passo-passo in questo topic (per pcr normale, ma se usi il SYBR è praticamente lo stesso).
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=1655
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi
Inserito il - 10 giugno 2007 : 00:23:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Confermo quanto dice chick, qualunque programma di disegno primer va bene e puoi usare benissimo primer3.

Se invece vuoi cercare se esistono primers già disegnati per il tuo gene puoi provare a guardare in questo database: RTPrimerDB
ce ne sono alti ma questo mi sembra il più completo.
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Mrselfdestruct
Nuovo Arrivato



8 Messaggi
Inserito il - 14 giugno 2007 : 14:45:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Mrselfdestruct Invia a Mrselfdestruct un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Primer3 va bene, anche se in realtà mi hanno suggerito di usare Primer Express perchè è più specifico per la Real Time.
Non so quali siano le effettive differenze però!
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 14 giugno 2007 : 23:37:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In realtà se usi il SYBR Green non ci sono grosse differenze nei primers... Se invece usi un approccio a 2 primer + sonda (es. Taqman) allora devi fare primer appositi
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