A livello di biologia molecolare o di bioinformatica?
come si fa a livello della biologia molecolare solo con il footprinting? o c'e' altro? a livello bioinformatico si dovrebbe usare l analisi linguistica (ragazzi ste cose dette cosi' mi sembrano tanto lontane dalla pratica),generalmente per l identificazione di promotori eucariotici dei vertebrati e' data dalla presenza delle isole GpC che si trovano al 5' dei geni e molti metodi per la predizione dei geni fanno uso delle matrici di peso (weight matrix),che tra l altro a quanto pare sono molto precise,una TATAbox e' conservatissima!,e appunto per questo anche il metodo del perceptrone credo che possa andare bene anche perche' alla base usa sempre matrici di peso.... e aggiungo un mio pensiero,secondo me le vie da usare sono diverse dipende cio' che hai a disposizione nella sequenza( e dipende se e' un promotore di classe I ,II o III)