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 trovare sequenza regione promotrice
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petronilla
Nuovo Arrivato



1 Messaggi

Inserito il - 15 giugno 2007 : 10:42:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di petronilla Invia a petronilla un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
qualcuno saprebbe dirmi cosa devo e come devo fare per trovare la sequenza della regione promotrice di un gene

chick80
Moderatore

DNA

Cittā: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 15 giugno 2007 : 23:27:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
A livello di biologia molecolare o di bioinformatica?

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Patrizio
Moderatore

mago

Cittā: Barcellona


1912 Messaggi

Inserito il - 16 giugno 2007 : 09:27:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da chick80

A livello di biologia molecolare o di bioinformatica?


come si fa a livello della biologia molecolare solo con il footprinting? o c'e' altro?
a livello bioinformatico si dovrebbe usare l analisi linguistica (ragazzi ste cose dette cosi' mi sembrano tanto lontane dalla pratica),generalmente per l identificazione di promotori eucariotici dei vertebrati e' data dalla presenza delle isole GpC che si trovano al 5' dei geni e molti metodi per la predizione dei geni fanno uso delle matrici di peso (weight matrix),che tra l altro a quanto pare sono molto precise,una TATAbox e' conservatissima!,e appunto per questo anche il metodo del perceptrone credo che possa andare bene anche perche' alla base usa sempre matrici di peso.... e aggiungo un mio pensiero,secondo me le vie da usare sono diverse dipende cio' che hai a disposizione nella sequenza( e dipende se e' un promotore di classe I ,II o III)


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makosky
Nuovo Arrivato


Prov.: Messina
Cittā: messina


3 Messaggi

Inserito il - 01 agosto 2007 : 21:17:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di makosky  Rispondi Quotando
Ma cosa vai cercando Petronilla Daniela

maco
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