specificità sonde TaqMan

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Autore

Discussione

ElisaB.
Nuovo Arrivato

Prov.: Torino
Città: Torino

6 Messaggi

Inserito il - 22 agosto 2007 : 08:59:27

Salve a tutti!

Da qualche tempo ho un dubbio a proposito delle sonde TaqMan... la specificità di una sonda TaqMan (MGB) è garantita dal fatto che essa ibrida con la sequenza target solo grazie ad un allineamento perfetto oppure esiste la possibilità che essa ibridi anche con una sequenza diversa da quella target che differisca da essa solo per uno o due nucleotidi? Ad esempio, una sonda lunga 20 nucleotidi è in grado teoricamente di ibridare e quindi dare un segnale in presenza di una sequenza ad essa complementare per 18 nucleotidi (ovviamente partendo dal presupposto che anche i primers usati non siano sufficientemente specifici solo per la sequenza target)?

Ringrazio moltissimo chiunque mi voglia aiutare a risolvere questo dubbio!

Ciao,

Elisabetta

chick80
Moderatore

Città: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 22 agosto 2007 : 13:04:53

Beh, ovviamente la sonda può essere più o meno specifica però il fatto di avere sonda più 2 primer rende il metodo Taqman più specifico ad es. del SYBR Green. (almeno in teoria, poi chiaramente in pratica può succedere di tutto e di più!)

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