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zerocool606
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5 Messaggi |
 Inserito il - 28 agosto 2007 : 11:29:16
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Come si costruisce questa mappa (in parole comprensibili)???
è giusto questo?
1- si inserisce dna in cromosomi yac, cioè cromosomi modificati contenenti siti di restrizione specifici e marcatori per riconoscerli
- il dna deve essere frammentato, perchè se no è di dimensioni troppo grandi
2- si transfettano i costrutti in cellule di lievito, che li possono contenere
3- gli yac in cellule di lievito replicano
4- si forma una genoteca genomica in cellule di lievito
ma c'è un problema: i frammenti di DNA perdono la loro posizione originale nel cromosoma, che deve essere ricostruita
5- questo è possibile perchè frammenti in YAC diversi presentano delle sequenze in comune, attraverso le quali è possibile ricostruire l'ordine esatto
Ogni sequenza ricostruita è un CONTIG. GIUSTO? o SBAGLIATO? non capisco se il contig è la sequenza ricostruita, cioè più frammenti presi ed attaccati oppure il singolo frammento presente in un YAC???
Cmq poi ci sono cmq sequenze che non possono essere ricostruite e perciò si deve usare un altro metodo
6- quindi si prendono dei marcatori genetici (a caso???) (polimorfici) e si vanno ad indviduare sui frammenti (giusto???) ---> se su due frammenti c'è lo stesso marcatore genetico allora è possibile assemblarli (giusto???) a questo punto i marcatori diventano fisici , perchè sono individuati sui contig che sono misurati in distanze fisiche (numero di basi) e quindi vengono chiamati MARCATORI STS
7- a questo punto cioè ultimata tutta la ricostruzione esattamente si ha la GENOTECA o la MAPPA DEI CONTIG DEI CLONI YAC???? è questo che non capisco??? che differnza c'è fra la genoteca e la mappa???
per mappare un gene poi si usa la genoteca o la mappa??? oppure tutte e due, cioè prima la genoteca per individuare il clone YAC in cui è presente il contig su cui si trova il gene da mappare e poi la mappa per vedere dove si trova quel contig e quindi mappare fisicamente il gene???
grazie dei chiarimenti
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mappe dei contig dei cloni yac --> HELP!!!HELP!!!
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