| Autore |
Discussione |
|
|
zerocool606
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
 Inserito il - 01 settembre 2007 : 20:48:26
|
|
Perchè per ricercare l'allele responsabile di una patologia in altre famiglie portatrici della stessa patologia si possono usare gli stessi marcatori, primer, ecc?
|
|
|
|
|
cge
Nuovo Arrivato
Città: Roma
105 Messaggi |
Inserito il - 01 settembre 2007 : 22:02:57
|
Ciao, perchè la sequenza da analizzare è la stessa, almeno se tu hai un solo marcatore. quindi in questo caso userai gli stessi primers e gli stessi protocolli per tutti gli individui.
se invece devi genotipizzare due polimorfismi diversi, dovrai generalmente utilizzare primers differenti, a meno che i due polimorfismi non si trovino nella stessa regione che puoi amplificare con una sola coppia di primers.
più chiaro?
S. |
 |
|
|
zerocool606
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 02 settembre 2007 : 09:08:10
|
la sequenza nucleotidica di un marcatore è la stessa in tutti gli individui???
ma nn sono polimorfici???
come fanno ad avere la stessa sequenza in individui di famiglie diverse di aree geografiche diverse? |
|
|
|
cge
Nuovo Arrivato
Città: Roma
105 Messaggi |
Inserito il - 02 settembre 2007 : 11:16:23
|
Come "stessa sequenza" intendo la posizione nel genoma del tratto che stai analizzando. solo il tratto che devia analizzare tu (il marcatore) è polimorfico, ma la sequenza che amplifichi e in particolare il punto in cui si legano i primer non sono polimorfici (generalmente è cosi, poi....), per cui tu puoi utilizzare gli stessi. Ad esempio, se hai una inserzione alu o un STR, la dimensione dell'amplificato sarà diversa tra gli individui, poichè si tratta di polimorfismi di lunghezza.
S. |
|
|
|
zerocool606
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 02 settembre 2007 : 13:20:02
|
quindi in pratica noi si deve ricercare due regioni una al 5' e l'altra al 3' del marcatore, che sono locus-specifiche e poi usare quelle per le analisi successive. Quelle sequenze nn sono polimorfiche al contrario del marcatore e quindi tutti ce l'hanno uguali
giusto?
grazie mille |
|
|
|
cge
Nuovo Arrivato
Città: Roma
105 Messaggi |
Inserito il - 02 settembre 2007 : 13:48:02
|
esatto. puoi disegnarti tu i primers in base alle sequenze contenute su genebank e con opportuni software (che ti danno temperatura di melting, dimensione dell'amplificato e altri parametri) oppure prenderli dalla letteratura, e utilizzarli per genotipizzare gli individui di qualsiasi popolazione.
S. |
|
|
| |
Discussione |
|
marcatori --> esame lunedì disperato
Didattica
