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rosa_rossa
Nuovo Arrivato
1 Messaggi |
 Inserito il - 25 settembre 2007 : 20:08:27
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Salve,
come ho scritto nel titolo dovrei svolgere un esercizio che chiede di scrivere in un file di testo alcune sequenze di DNA.
Io ho fatto in questo modo:
sono andata su ncbi, ho selezionato gene ed ho inserito una query (x esempio nras). quando mi si apre la pg con tutte le informazioni, ho cliccato sul link nero centrale sopra la figura che rappresenta esoni-introni.
è giusto?? 
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Schuldiner86
Utente Junior
Prov.: Viterbo
Città: Bologna
581 Messaggi |
Inserito il - 25 settembre 2007 : 20:46:34
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| Se clicchi sulla scritta nera, quella che ha il codice che inizia per NC_ecc... , se vuoi la sequenza devi cliccare sul formato FASTA e ti si apre l'intera sequenza del gene, senza regioni codificanti o non codificanti...Se vuoi la sequenza trascritta nell'mRNA devi cliccare sul codice a lato con scritto NM_ecc e per la sequenza e basta ti conviene sempre il formato FASTA...se vuoi la regione codificante clicchi su NC_ecc e selezioni GeneBank, ad un certo punto nella pagina sulla sinistra c'è scritto CDS...Nella prima riga troverai (metto numeri a caso) join(321...876,985...1000) e sai che ci sono 2 esoni corrispondenti alle regioni scritte in quel join e te li puoi andare a cercare sulla sequenza... |
 
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Marygrace
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
Città: Napoli
3 Messaggi |
Inserito il - 15 ottobre 2007 : 17:19:05
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Scusate, avrei bisogno di un'informazione : sto facendo una ricerca sulla ribonucleotide reduttasi umana.. Sono andata sul sito NCBI per trovare la sequenza genomica contenente la CDS per tale proteina. Ho fatto un'analisi degli introni e degli esoni ma per quanto riguarda gli introni mi sono trovata dinanzi qualcosa che non avevo mai visto prima : tra un introne e l'altro sono presenti dei gap chiamati "expand ns" che, a quanto pare, rappresenterebbero dei nucleotidi qualsiasi (perchè indicati con N) di cui però non ho compreso la funzione.. Perchè gli introni sono "spezzati"? Cosa stanno ad indicare questi gap?
Vi ringrazio anticipatamente
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Mariagrazia |
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