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Lorenzo
Nuovo Arrivato
10 Messaggi |
 Inserito il - 22 maggio 2005 : 19:31:44
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Ciao a tutti,sono alle prime esperienze con l'interpretazione delle sequenze da PCR e ovviamente non sono ancora esperto ne tantomeno in grado di conoscere trucchi o sottigliezze,qualcuno saprebbe indicarmi una qualunque cosa (manuali,libri,siti)che potrebbero aiutarmi a migliorare l'interpretazione o dite che solo l'esperienza mi farà migliorare??
Ovviamente sono ben accetti anche tutti i vostri suggerimenti
Grazie a chiunque abbia voglia di aiutarmi
Ciao
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biomagen
Nuovo Arrivato
Città: Barcellona
19 Messaggi |
Inserito il - 22 maggio 2005 : 22:01:01
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Ciao Lorenzo, anche io ho avuto un pò di esperienza con le sequenze e fidati non sono i libri che rendono più acuta la tua interpretazione, per quella ci vuole pratica.
Anche se è pur vero che delle "nozioni" di base sono utili, soprattutto per risolvere i "grandi enigmi" del perché una sequenza non riesce!
A volte, per dirne una, vi sono delle regioni ricche in GC che possono bloccare il sequenziamento.
Comunque , se posso darti un consiglio, per qualunque problema parlane anche con il servizio sequencing, sicuramente loro potranno darti un consiglio o comunque una risposta ad eventuali dubbi.
ciao ciao |
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Manz
Nuovo Arrivato
Prov.: MI, PV
Città: Milano, Mortara
27 Messaggi |
Inserito il - 03 giugno 2005 : 13:41:09
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Ciao Lorenzo!
Se il tuo topic è inserito qua, ne deduco (ah la pespicacia!) che non ti serva aiuto per la realizzazione "fisica" delle sequenze (banalmente, la reazione).. se ho toppato chiedi pure posso darti dei consigli!
In realtà ciò che ti ho appena scritto non è così scombinato, poichè se una sequenza continua a venirti "male" per via informatica puoi fare ben poco (leggi: niente), bensì moltissimo puoi fare se sei tu a fare direttamente le sequenze (altrimenti, puoi sempre parlare col laboratorio a cui spedisci le PCR da sequenziare), e puoi limare ancora un po' di pulizia nella procedura di precipitazione.
Cosa intendi con "migliorare l'interpretazione"? Parli della gestione del software di allineamento, dell'interpretaizone di picchi "ambigui"? Se intendi questo, in effetti più esperienza hai nel valutare la forma dei picchi, l'andamento dell'elettroferogramma e cose simili più informazioni riesci ad estrapolare dalla sequenza!
Se hai un problema specifico posta pure
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Come dici? Ma certo, che sono il prescelto! Non penserai mica che fosse quello stupido bambino biondo che spostava gli oggetti col pensiero, e che ha traslocato da casa questa mattina?
http://sabaroth.altervista.org/JMP/ - Journal of Molecular Proctology |
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Lorenzo
Nuovo Arrivato
10 Messaggi |
Inserito il - 22 giugno 2005 : 08:28:30
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Ciao Manz,effettivamente il mio vero problema era l'interpretazione della sequenza,cioe di picchi ambigui,come riconoscere mutazioni,in quanti aspetti posso trovarmele ecc ecc,mi rendo conto,però che l'esperienza forse è l'unica soluzione,cioè piu ne vedo e piu "Faccio l'occhio",per dirla alla buona,cmq se conosci qualche bel link o qualche bel manuale(dubito esistano manuali sull'interpretazione delle sequenze),mandamelo di corsa!
Grazie mille,ciao |
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