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 come funziona il salting out
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cioppy
Nuovo Arrivato

Prov.: Palermo
Città: Palermo


1 Messaggi

Inserito il - 26 novembre 2007 : 17:44:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cioppy Invia a cioppy un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
per favore...domani ho un esame...qualcuno puo spiegarmi come funziona il saltin out per estrarre il Dna da sangue intero..

Giorgia Adamo

Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 26 novembre 2007 : 19:49:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Il salting out, applicato a soluzioni proteiche, consiste nell’aggiunta di sale ad un
omogenato (oppure al plasma), al fine di ridurre la solubilità delle proteine e costringerle a precipitare.
Gli ioni salini, attirando a sé una gran quantità di molecole d’acqua, disidratano la
componenente proteica e quindi eliminano i clatrati, “gusci” di molecole d’acqua
geometricamente ordinate che ricoprono le regioni idrofobiche scoperte delle proteine formando una
tensione superficiale concettualmente paragonabile a quella tra acqua ed aria.

In questo modo le proteine possono facilmente aggregarsi tra di loro tramite
l'interazione delle catene laterali idrofobiche, senza però denaturare o alterarsi.
Gli aggregati proteici possono così facilmente precipitare, senza bisogno di lunghi
tempi di centrifugazione, formando precipitati che sono facilmente conservabili
in quanto protette sia da contaminazioni batteriche che da attività proteolitiche.

La concentrazione del sale in grado di distruggere i clatrati è diversa da proteina a
proteina; le proteine molto idrofobiche precipitano a bassa concentrazione, mentre
quelle meno idrofobiche precipitano ad alta concentrazione di sale in quanto occorre
sequestrare loro una maggiore quantità d’acqua per far sì che perdano completamente
il contatto con il solvente: il sequestro di acqua coincide infatti con un discioglimento
in un volume d’acqua relativamente minore, e quindi con un aumento di concentrazione.
A tutti questi fattori si somma la formazione di complessi ioni-proteina che precipita
perché eccede il suo prodotto di solubilità, che risulta determinato della particolare
composizione amminoacidica di ciascun tipo di proteine.

Il sale più usato è il solfato d’ammonio (NH4)2SO4 , scelto soprattutto perché è
molto solubile in acqua e nemmeno a concentrazioni elevate denatura le proteine.
(Il solfato di sodio può talvolta sostituirlo)

La precipitazione con solfato d’ammonio è un esempio di precipitazione reversibile: basta allontanarlo perché la proteina torni in soluzione. Il metodo più semplice per allontanare il sale è la dialisi attraverso membrane semimpermeabili, che consente di rimuovere anche contaminanti a basso peso molecolare o cambiare tampone. La proteina precipitata è posta in un sacchetto costituito da una membrana di questo tipo che è immerso in un volume molto maggiore di soluzione tampone o H2O. I pori della membrana semimpermeabile lasciano passare solo le molecole di piccole dimensioni e non le proteine e nel giro di qualche ora, cambiando spesso la soluzione esterna, i sali sono eliminati dalla soluzione interna e la proteina torna in soluzione.

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

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maripa86
Nuovo Arrivato


Prov.: Palermo
Città: Palermo


5 Messaggi

Inserito il - 27 novembre 2007 : 01:41:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di maripa86  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di maripa86 Invia a maripa86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
E invece qual'è il principio applicato al Dna... è lo stesso???
Cioppy in ke facolta sei inscritto/a?
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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 28 novembre 2007 : 19:57:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
E invece qual'è il principio applicato al Dna... è lo stesso???


Chimicamente sì, con la sola differenza che il DNA - essendo un acido-
tende a precipitare per formazione di sali di fosfato insolubili (per
la precisione sali di 'deossiribofosfato') più che per aggregazione.

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

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Caffeine
Nuovo Arrivato

cat



3 Messaggi

Inserito il - 25 aprile 2009 : 20:02:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Caffeine Invia a Caffeine un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie Dionysos per l'esauriente risposta, mi è stata utile!
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MissPat
Nuovo Arrivato

Birds

Città: Roma


2 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2010 : 15:03:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di MissPat Invia a MissPat un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie della spiegazione!!!
anche a me è stata utile!!!
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studentessa90
Nuovo Arrivato

tecnico di lab

Prov.: napoli


25 Messaggi

Inserito il - 12 giugno 2011 : 19:53:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di studentessa90 Invia a studentessa90 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie anche a me
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cidsmoke
Utente Junior



534 Messaggi

Inserito il - 12 giugno 2011 : 21:28:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cidsmoke Invia a cidsmoke un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
E molto semplice:
si separano i globuli bianchi dal sangue intero,le cellule quindi vengono lisate(usando SDS,proteinasi K,o altro)quindi si precipitano le proteine con elevate concentrazioni saline,si allontana il precipitato(che contiene le proteine)e quindi si risospende il surnatante(che contiene il DNA)in etanolo al 70%.A questo punto si ricentrifuga e il surnatante con il DNA ora visibile(tipo una medusa)si ridisciogli in tampone TE(tris-EDTA)e il gioco è finito!
Hai il tuo bel DNA per farci quello che vuoi!
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