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CIA
Utente Junior
Prov.: Padova
Città: Rivadolmo
233 Messaggi |
 Inserito il - 18 luglio 2005 : 21:37:10
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Ciao, sono nuova di qui... ho chiesto anche in altri forum... non è che qualcuno mi può dire qualcosa sul LOD SCORE? Più che altro avrei difficoltà (molta) con il calcolo
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CIA
Se è verde o si muove, è biologia. Se puzza, è chimica. Se non funziona, è fisica.
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valia
Moderatore
Prov.: UK
1001 Messaggi |
 Inserito il - 19 luglio 2005 : 10:43:58
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Ciao! Io l'ho studiato l'anno scorso dallo Strachan e Read.. Mi sembrava fosse spiegato bene! Dal punto di vista del calcolo si tratta di calcolare il logaritmo del rapporto tra due probabilità, che sono:
-Probabilità di osservare un certo numero di ricombinanti assumendo che ci sia associazione tra i due loci considerati
-Probabilità di osservare un certo numero di ricombinanti, assumendo che non ci sia linkage tra i due loci
Infine si calcola il valore del Lod Score in funzione di diverse probabilità di ricombinazione (da 0 a 0.5).
Le cose si complicano un pò se hai un albero a FASE NON NOTA, cioè se non sai qual'è l'allele che viene ereditato con la malattia, o col fenotipo in questione. In questo caso devi calcolare entrambi i rapporti delle probabilità, farne la media, e poi calcolarne il logaritmico...
Se hai problemi specifici fammi sapere..
PS Sei al terzo anno di Bio Molecolare, indirizzo Bio sanitario? Esame con la Russo?? |
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CIA
Utente Junior
Prov.: Padova
Città: Rivadolmo
233 Messaggi |
Inserito il - 25 luglio 2005 : 14:56:50
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e come si fa a calcolare entrambi i rapporti delle probabilità?
PS. Sono a Ferrara e faccio biotecnologie |
CIA
Se è verde o si muove, è biologia. Se puzza, è chimica. Se non funziona, è fisica.
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valia
Moderatore
Prov.: UK
1001 Messaggi |
Inserito il - 25 luglio 2005 : 15:18:38
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Prima assumi che l'allele ereditato con la malattia sia A, conti i ricombinanti nei due casi, calcoli le due probabilità e ne fai il rapporto.
Poi assumi che l'allele ereditato con la malattia sia a. Fai come sopra, e ti trovi il secondo rapporto di probabilità!
Detto così sembra molto complicato... Ma se tu hai lo strachan posso spiegarti un esempio specifico! Altrimenti ti mando un albero e la soluzione di un esercizio tipo via e-mail..
che dici? |
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CIA
Utente Junior
Prov.: Padova
Città: Rivadolmo
233 Messaggi |
Inserito il - 26 luglio 2005 : 11:10:25
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| Ecco! brava... Mi faresti un grande piacere! la mia mail la trovi nel profilo... GRAZIE 1000! |
CIA
Se è verde o si muove, è biologia. Se puzza, è chimica. Se non funziona, è fisica.
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valia
Moderatore
Prov.: UK
1001 Messaggi |
Inserito il - 26 luglio 2005 : 11:22:01
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Dal profilo non posso vedere il tuo indirizzo, posso comunque mandarti un e-mail ma non posso aggiungere l'allegato (o meglio, non so se si possa fare, ma cmq io non son capace!!).
...forse è il caso che tu mi dia il tuo indirizzo... |
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LOD SCORE
