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MirrorHole
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14 Messaggi

Inserito il - 17 gennaio 2008 : 22:42:42

Ciao a tutti!
Qualcuno sa dove posso trovare delle informazioni sull'algoritmo del programma di threading PHYRE (http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre/index.cgi)?...su Google non ho trovato nulla...

...accendere una candela � gettare un'ombra...

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 18 gennaio 2008 : 10:30:27

A quanto ne so PHYRE dovrebbe essere l'implementazione successiva di 3D-PSSM.

Attualmente per fare threading credo che sia meglio non affidarsi ad un solo programma per� (non so le ultime del CASP ma PHYRE e SwissModel non credo siano piu' il non-plus-ultra).

La scelta migliore sarebbe quella di sottomettere la sequenza ad un metaserver (ad es. bioinfobank), crearti una libreria di templati con i relativi allineamenti, e costruirti i modelli con Modeller

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada