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BIOGIOVY
Nuovo Arrivato


Prov.: Napoli
Cittā: NAPOLI


2 Messaggi

Inserito il - 21 gennaio 2008 : 01:16:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di BIOGIOVY Invia a BIOGIOVY un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Qualcuno č pratico di banche dati?
L'esercizio č:
data la sequenza nucleotidica con accession number NM_018032 cercare nella NCBI la lunghezza del tratto codificante, della 3 UTR e della 5 UTR.
Vi prego aiutatemi ho un'esame tra qualche giorno!!!!!
Help Me

chick80
Moderatore

DNA

Cittā: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 21 gennaio 2008 : 01:39:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao!

E' molto semplice:

1) Vai su NCBI
2) Nel box Search scegli il database Nucleotide e scrivi l'accession number
3) Ti troverā 1 risultato:
Homo sapiens LUC7-like (S. cerevisiae) (LUC7L), transcript variant 1, mRNA
gi|41393557|ref|NM_018032.3|[41393557]
4) Visualizzi la sequenza (a questo punto dovresti essere su questa pagina) e puoi trovare un sacco di informazioni sul gene (cosa fa, links ad articoli etc)
Per trovare la lunghezza della CDS vai verso metā pagina, nella sezione FEATURES e trovi:

  gene            1..2082
  CDS             112..1089


Il che vuol dire che la sequenza riportata (dal nt 1 al 2082) č tutto il gene e la coding sequence č tra la posizione 112 e la 1089.

Sempre nella stessa sezione trovi anche le posizioni dei vari esoni

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