Copy number variation su un gruppo di pazienti

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drferrara
Nuovo Arrivato

1 Messaggi

Inserito il - 24 gennaio 2008 : 19:52:19

ragazzi devo fare uno studio di copy number variation di un gene su un gruppo di pazienti.

Il gene ha circa otto possibili copy number tra duplicazioni e pseudogeni sullo stesso cromosoma

domanda 1. mi potete suggerire la metodica pi� rapida ed efficace?

domanda 2. (la pi� importante) devo fare un allineamento tra le otto sequenze del gene per trovare eventuali differenze di sequenza cos� da poter eventualmente usare la rt-pcr per i cnv

Grazie a tutti quelli che mi aiuteranno stasera

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 25 gennaio 2008 : 08:46:59

Citazione:
Messaggio inserito da drferrara

domanda 2. (la pi� importante) devo fare un allineamento tra le otto sequenze del gene per trovare eventuali differenze di sequenza cos� da poter eventualmente usare la rt-pcr per i cnv

Non me ne intendo molto di CNV, comunque se devi fare un allineamento multiplo ClustalW dovrebbe essere un must...

http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada