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MRS
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3 Messaggi

Inserito il - 28 gennaio 2008 : 10:04:42

Salve a tutti,
da sempre lavoro con gli AFLP per fare fingerprinting varietale e fin quando ho usato la radioattivita' non ho mai avuto problemi. Per ovvie ragioni vorrei passare ad utilizzare la fluorescenza (6-FAM) e ho fatto alcune prove ma i risultati sono disastrosi. Ricevuti gli spettri dal servizio esterno a cui ho richiesto la corsa elettroforetica (sequnziatore ABI3730)utilizzo GENEMARKER 1.7 come software per trasfrmere la presenza o l'assenza di picchi in una matrice che analizzo poi con l'analisi delle compom�nenti principali. La PCA mi restituisce una dispersione dei campioni in funzione della loro correlazione genetica. Il mio problema e' che con i dati ottenuti dagli AFLP fluorescenti quando metto insieme dati da esperimenti fatti in tempi differenti, il cluster che ottengo non e' piu' basato sulla correlazione genetica tra i campioni ma sulla data in cui i campioni sono stati analizzati.
Qualcuno ha qualche idea del perche'?
Grazie in anticipo

franskite
Nuovo Arrivato

13 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2008 : 11:48:00

buongiorno,
ho letto questo tuo messaggio...spiacente ma non so come aiutarti!!!
forse tu potresti aiutare me....visto che avrei bisogno della traduzione di questo articolo

AFLP: A NEW TECHNIQUE FOR DNA FINGERPRINTING
Pieter vos et al., 1995 vol.23, nucleic acids research

grazie mille