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RNA world
Utente Junior

dna


370 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2008 : 08:46:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Cari utenti ,

parte da oggi (in prova) una nuova sezione dedicata alle review che ci sono piaciute particolarmente, e che vogliamo far leggere anche agli altri.

Piccole regole (amministratori sono sicuro avete delle idee migliori):

Mettere tra parentesi il campo di ricerca seguito da un titolo in italiano che riassuma l'articolo

Aggiungere piccolo commento che descriva l'articolo.

Altre idee...

RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2008 : 08:55:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Dopo diverse discussioni sull'argomento e rischieste di articoli , inserisco una review recente e riassuntiva:

[Biologia Molecolare Eucarioti]- MicroRNA

I miRNA (e tutti i piccoli RNA) stanno rivoluzionando la biologia molecolare negli ultimi anni. Tutte le regolazioni geniche che pensavamo aver capito hanno invece ulteriori livelli di regolazione (trascrizionale e post trascrizionale) che aumentano quindi la complessità degli organismi. Un mondo affascinate quello dei piccoli RNA.
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domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1534 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2008 : 11:26:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
RNA world, si era detto di non mettere direttamente gli articoli per motivi di copyright. Non mi pare che l'articolo sia free. Dovresti lasciare il link, non il file .pdf


P.S. Si potrebbe mettere il topic in rilievo?

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2008 : 11:42:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Giusto, allora meglio mettere solo il link.

Questo significa che possiamo mettere il link solo ai giornali accessibili a tutti ?

grazie
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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
Città: Milano


2484 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2008 : 12:58:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Bhè il link alla rivista/a pubmed lo si può mettere: solo chi ha i dati di login o sia nella rete/proxy universitario riesce ad accedere..
Ricordo che Plos è invece utilizzabile liberamente.

PS: Ho tolto l'allegato, e metto ora in rilievo il topic

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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11486 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2008 : 21:53:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ehmmmm.... però metti il link all'articolo! Lo vorrei leggere! :)

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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2008 : 21:56:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Potresti pensare ad usare qualche sistema tipo citeUlike/connotea per annotare gli articoli che proponi, così poi ti ne avrai una lista già pronta. Se non mi sbaglio era anche in preparazione una applet per aggiungere cose su mb, vero? :)

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 04 marzo 2008 : 20:41:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ecco il link delle review che ho letto qualche giorno fa sui piccoli RNA:


[Biologia Molecolare]-MicroRNAs: SMALL RNAs WITH A BIG
ROLE IN GENE REGULATION

http://www.nature.com/nrg/journal/v5/n7/abs/nrg1379.html

Come avevo scritto sopra quest'articolo riassume quello che si sa (a grandi linee) sui piccoli RNA, e sul complesso sistema di regolazioni che sottendono, sconvolgendo i networks di segnalazioni intracellulari che fino a qualche anno fa credevamo essere più o meno definiti.

ciao

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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 15 marzo 2008 : 08:28:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,

allego il link ad un articolo che ho letto in settimana:

[NUTRIZIONE]: Nutrition and cancer: A review of the evidence for an anti-cancer diet


http://www.nutritionj.com/content/3/1/19

La probabilità di insorgenza di circa il 30% dei tumori può essere ridotta attraverso una dieta corretta ed una vita "sana".
Questa review fa un'alenco di tutti gli alimenti anti-cancro e di quelli che sembrerebbero aumentarne l'incidenza.

L'articolo è in open access, quindi potete scaricarlo comodamente da casa.

Ciao!
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 19 marzo 2008 : 19:17:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando

THE RIBOSOME FILTER HYPOTESIS

In quest'articolo viene proposto un ulteriore meccanismo di controllo post-traduzionale. In particolare i ribosomi potrebbero essere in grado di legare preferenzialmente certi tipi di mRNA e quindi di tradurli con maggiore efficienza. Questo si correla molto bene con le espressioni "tessuto-specifiche"... Buona lettura

L'articolo è in open access, quindi si legge anche da casa.




http://www.pnas.org/cgi/content/full/99/19/12031
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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 19 marzo 2008 : 19:35:37  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[Immunologia]- Chemochine e Homing

Una minireview molto carina, che illustra quanta perfezione
stia dietro ai meccanismi di homing che permettono la
localizzazione tessuto-specifica dei linfociti - diretta
da doppio contributo di chemochine e molecole d'adesione
ad espressione tessuto-specifica, il cui accoppiamento
genera una combinazione unica ed altamente selettiva.
Davvero affascinante.

http://www.immunity.com/content/article/abstract?uid=PIIS1074761301002618

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 25 aprile 2008 : 17:02:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[Bio Molecolare]- miRNA


Ciao a tutti,

segnalo quest'interessante articolo uscito da poco meno di un mese,
riguardo le implicazioni terapeutiche dei miRNA.

All'interno c'è una descrizione del meccanismo dei miRNA (e dei siRNA)
e alcuni target molecolari interessanti.

Articolo in openaccess, quindi lo scaricate senza problemi.

http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?artid=1978219&blobtype=pdf

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darkene
Utente Junior

occhi



291 Messaggi

Inserito il - 30 aprile 2008 : 12:03:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di darkene Invia a darkene un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[GENETICA] - Mitochondrion and its related disorders: making a comeback

Una mini-review per la serie "il mitocondrio, questo sconosciuto"!

http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?artid=2225489&blobtype=pdf
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1297 Messaggi

Inserito il - 30 aprile 2008 : 14:16:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[Bioinformatica] - miRNA

Questo articolo propone un metodo alternativo per la predizione di target a cui puntano i miRNA. Il fatto interessante è che l'algoritmo adotta un metodo con solo parametri termodinamici, senza tener conto del grado di conservativita' della sequenza. Eppure pare ci azzecchi bene tanto quanto miRanda e altri.

http://www.nature.com/ng/journal/v39/n10/abs/ng2135.html

P.S.: accanto al link diretto io proporrei di aggiungerci una referenza di PubMed se possibile tipo (ine questo caso):

Kertesz M, Iovino N, Unnerstall U, Gaul U, Segal E.
The role of site accessibility in microRNA target recognition.
Nat Genet. 2007 Oct;39(10):1278-84. Epub 2007 Sep 23.
PMID: 17893677 [PubMed - indexed for MEDLINE]

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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frau_frosch
Utente Junior

Mourn

Città: Boston


225 Messaggi

Inserito il - 06 maggio 2008 : 22:33:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di frau_frosch Invia a frau_frosch un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[TERAPIA GENICA] - Ribozimi in terapia genica

Lewin AS, Ribozyme gene therapy: applications for molecular medicine, Trends Mol Med,2001 May;7(5):221-8.

è una review del 2001, un po' vecchiotta ma molto ben scritta. un articolo da leggere! Per chi fosse interessato, questo è il PubMed Index.

PMID: 11325634

Unico problema: disponibile gratuitamente solo l'abstract...come al solito!
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11486 Messaggi

Inserito il - 07 maggio 2008 : 00:46:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[NEUROSCIENZE] - Effetti eccitatori del GABA

Excitatory effects of GABA in established brain networks. - Trends Neurosci. 2005 Jun;28(6):284-9

PMID: 15927683

Il GABA viene generalmente considerato come IL neurotrasmettitore inibitorio nel cervello adulto (mentre è eccitatorio nell'embrione). Negli ultimi anni, tuttavia, sempre più lavori hanno mostrato che effetti eccitatori del GABA persistono anche nell'adulto. Questa interessante review fa un po' il punto della situazione a riguardo.

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CIA
Utente Junior

Gir studying

Prov.: Padova
Città: Rivadolmo


233 Messaggi

Inserito il - 07 maggio 2008 : 13:10:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di CIA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di CIA  Invia a CIA un messaggio Yahoo! Invia a CIA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Interessante questo post degli articoli

CIA
Se è verde o si muove, è biologia. Se puzza, è chimica. Se non funziona, è fisica.
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1297 Messaggi

Inserito il - 07 maggio 2008 : 14:36:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Questo post si sta allungando, mi sembra poco agevole scorrerlo...

Non si potrebbe mettere su una pagina dedicata, magari un RSS dedicato?

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 07 maggio 2008 : 17:57:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Infatti...

il top sarebbe riuscire a leggere il nome dell'articolo inserito senza dover caricare la pagina della discussione...


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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 11 maggio 2008 : 17:03:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,

oggi vi propongo un review davvero interessante, in cui viene data una spiegazione chimica e termodinamica al fatto che molte malattie neurodegenerative, come il Parkinson, l'Alzhaimer, la sclerosi laterale amiotrofica, il famoso morbo della mucca pazza, sono tutte causate dalla formazione di aggregati proteici che formano fibre amiloidi.

La formazione di fibre amiloidi è spinta termodinamicamente dal fatto che è lo stato a più bassa energia a cui si può trovare un aggregato proteico.

[Chimica Bioorganica] - Folding versus aggregation: Polypeptide
conformations on competing path

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17588526

PMID: 17588526


PS: Che ne dite di trovare un modo piu' pratico per visualizzare questa pagina?

Grazie
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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
Città: Milano


2484 Messaggi

Inserito il - 12 maggio 2008 : 01:37:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
kORdA, RNA World ci stiamo pensando/lavorando su..
Grazie per i suggerimenti.

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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 12 maggio 2008 : 12:06:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Intanto, mentre Riccardo ci lavora su, fate un giro su:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18023981

[BIOCHIMICA CELLULARE] - Sialidasi come potenziali oncogeni

Enzimi glico-idrolitici associati alla membrana, un tempo
concepiti unicamente come catabolizzatori degli zuccheri ,
sono oggi considerati modulatori del cell signaling (al pari
delle 'cugine' fosfolipasi) sia diretti che indiretti, grazie
alla loro capacità di modulare il profilo glicolipidico della
membrana. Questa review illustra come una simile attività
enzimatica possa, qualora upregolata, portare la cellula ad un
fenotipo invasivo. La sialidasi Neu3 ( oggetto peraltro
della mia tesi ) risulta significativamente upregolata
in due tipologie di carcinomi epiteliali umani.


N.B. ci sono anche i disegnini!!!!!

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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 19 maggio 2008 : 21:52:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[NEUROSCIENZE] - Reinnervazione glutammatergica del muscolo scheletrico

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16723220

A voi han sempre insegnato che il muscolo scheletrico
agisce su stimoli neurochimici provenienti da una
innervazione colinergica? pure a me!
eppure ...

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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 09 giugno 2008 : 21:08:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
[Biologia Molecolare]- Cu- Zn Superossido Dismutasi


Ecco una bella review sulla superossido dismutasi, un enzima che non solo catalizza la dismutazione dello ione superossido in acqua ossigenata, ma oggi è molto studiata perchè una delle principali cause di sclerosi laterale amiotrofica.

Questa review punta ad una introduzione generale dell'enzima , e cerca di spiegare come l'aggregazione possa portare alla formazione di fibre amiloidi che portano alla degenerazione dei motoneuroni.

Questo articolo si correla molto bene all'ultimo che avevo messo, sul protein foldig e sull'aggregazione.

Posttranslational Modifications in Cu,Zn-Superoxide Dismutase
and Mutations Associated with Amyotrophic Lateral Sclerosis

YOSHIAKI FURUKAWA1,2 and THOMAS V. O'HALLORAN1
Antioxid Redox Signal. 2006 ; 8(5-6): 847–867.

PMID: 16771675

PS: è ancora valida l'idea di dare una collocazione diversa a questa discussione?

Ciao
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Iside
Utente Attivo

Iside_paradise

Città: Napoli


1375 Messaggi

Inserito il - 23 giugno 2008 : 12:40:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Iside  Invia a Iside un messaggio Yahoo! Invia a Iside un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
segnalo:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11413462

Le fasi dei checkpoint mitotici sono fondamentali per dirigere una corretta divisione delle cellule e molte proteine ad attività chinasica giocano un ruolo decisivo nel regolare tali processi. La review offre una visione ampia e dettagliata delle principali classi di chinasi che intervengono nel processo mitotico, e l'autore pone luce su un particolare momento della divisione mitotica ancora oggi poco conosciuto: il Golgi checkpoint.
buona lettura

...we're just two lost souls swimming in a fishbawl...year after year...
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 02 luglio 2008 : 21:00:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sequenziamento di peptidi - [Spettrometria di massa]

Vi segnalo una semplice ed interessante review nel caso aveste voglia di ripassare o capire come si può identificare una proteina usando la spettrometria di massa.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed&cmd=search&term=nrm1468

oppure se volete scaricare direttamente il pdf:

http://www.imsb.ethz.ch/researchgroup/wbernd/Downloads/Peptide_sequencing

Ciao!

PS: piuttosto simpatico il titolo di questa review...

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