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netbridge85
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AppleTangerine
Prov.: Milano
Città: Milano


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Inserito il - 12 marzo 2008 : 08:38:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di netbridge85 Invia a netbridge85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti, magari qualcuno di voi sa darmi delucidazioni su questo fenomeno: perchè una proteina transmembrana porta sempre l'estremità amminoterminale rivolta verso l'ambiente extracellulare e l'estremità carbossiterminale rivolta verso l'ambiente citosolico? Immagino abbia un significato potenzialmente funzionale, ma principalmente deriva dalla differenza di pH tra i due ambienti. Qualcuno sa darmi info certe? grazie mille

Se ti tramuti in qualcosa di più di un semplice uomo, se consacri te stesso a un ideale e se nessuno riesce a fermarti allora diventerai una leggenda!

la_fra
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betty



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Inserito il - 12 marzo 2008 : 12:04:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di la_fra  Rispondi Quotando
al momento non posso dilungarmi piu di tanto perche sono in lab ma ti assicuro che la disposizione delle proteine transmembrana può essere anche invertita,con il C-term all'esterno e l'N-term all'interno
quando ho un momento di dico qualcosa di +

Doctors are men who prescribe medicines of which they know little, to cure diseases of which they know less, in human beings of whom they know nothing (Voltaire)
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la_fra
Utente

betty



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Inserito il - 12 marzo 2008 : 12:05:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di la_fra  Rispondi Quotando
nel senso che ci sono prot transmembrana con un orientamento e altre con l'orientamento inverso

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netbridge85
Nuovo Arrivato

AppleTangerine

Prov.: Milano
Città: Milano


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Inserito il - 12 marzo 2008 : 13:17:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di netbridge85 Invia a netbridge85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ohi grazie allora aspetto che ti liberi e quando puoi magari mi dici in che modo o cosa lo stabilisce...grazie mille cmq

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Biotecnologo1987
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Future

Prov.: Teramo
Città: teramo


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Inserito il - 12 marzo 2008 : 19:17:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Biotecnologo1987 Invia a Biotecnologo1987 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao...allora adesso tento di spiegarti quello ke so io:
Allora è importante sapere che le proteine hanno una loro localizzazione all'interno della cellula...questa localizzaz è scaturita da una sequenza segnale scritta nella proteina(o C terminale, o N terminale o al centro!)Però una proteina può avere più segnali x esempio se deve raggiungere la membrana interna del mitocondrio (citocromo c ossidaso oppure complesso ATP-asi ecc) essa ha bisogno di 2 segnali uno x raggiungere la membrana esterna e l'altro x entrare dentro!per cui le proteine di membrana vengono divise in 3 gruppi:
1)gruppo 1 N fuori e C dentro
2)gruppo 2 C fuori e N dentro
3)gruppo 3 devi distinguere in base al numero di domini transmembrana:
se pari: sia N che C dentro
se dispari: N fuori e C dentro;
Comunque devi sapere che i domini transmembrana sono formati da alfa-eliche di 21-26 AA idrofobici ma possono formare anche domini a barile(beta sheet)...possiamo trovare però anche AA idrofili però essi interagiranno tra di loro formando un canale acquoso proteico e ovviamente transmembrana...se vuoi appena ho un pò di tempo ti parlo dell'ancoraggio delle proteine alla membrana ed i vari segnali lipidici(lipidazione) che permettono il loro ancoraggio...il pH estremo contribuisce alla loro estrazione ma non influisce sulla disposizione come anche le forze ioniche...come hai detto tu la localizzazione delle proteine è funzionale alla sua conformazione nativa...spero che sono stato chiaro...ciao...

Davide*
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netbridge85
Nuovo Arrivato

AppleTangerine

Prov.: Milano
Città: Milano


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Inserito il - 13 marzo 2008 : 08:41:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di netbridge85 Invia a netbridge85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ma questa suddivisione che mi hai fatto è assoluta o dipende comq dal tipo di modificazioni che subisce nel Golgi? nel senso se viene predsposposta in un modo nel RE e poi va nel golgi, subisce delle modificazioni di gruppi chimici, catene latterali ecc...ma potrebbe riguardare anche la disposizione ultima della proteina? ed inoltre un mio amico mi ha detto che la proteina transmembrana nella gran parte dei casi assume una conformazione COOH dentro la cell e NH3+ fuori perchè così contribuisce a creare il potenziale elettrico e quindi permettere gli scambi di sostanze. però dice anche che tutto ciò è relativo perchè dipende cmq dalla funzione ultima della prot. in quanto ci sono casi in cui come per un carrier transmembrana è necessario esporre determinati aa per legare il substrato....penso che il destino di una p.transmembrana dipenda da molti fattori diversi. Cmq per qunato riguarda ancoraggio & co non ti preoccupare davide, ho già controllato il mio testo,, che ne fa una buona trattazione...ti ringrazio cmq per la disponibilità.

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la_fra
Utente

betty



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Inserito il - 18 marzo 2008 : 14:53:25  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di la_fra  Rispondi Quotando
ciao finalmente riesco a rispondere, allora quello che so riguarda le proteine appena prodotte, che poi nel Golgi assumano altre modifiche e alla fine in base a queste caratteristiche una proteina resti solubile o vada nei lisosomi o ai mitocondri ecc è cmq indipendente dall'orientamento che assumono, che è invece collegato alla presenza di una sequenza segnale nella proteina. Per le proteine solubili questa sequenza ha 2 funzioni
1) dirige la proteina neosintetizzata alla membrana dell'ER
2) serve da segnale di inizio trasferimento
una volta che il C-term della proteina è passato attraverso la membrana la proteina traslocata è rilasciata nel lume dell'ER e la -sequeza segnale degradata da altre proteasi dell'ER.
Nelle proteine TM a singolo passaggio, la proteina viene inserita in membrana in 3 modi
-nel caso + semplice una sequenza segnale N-terminale inizia la traslocazione proprio come per una proteina solubile, ma un segmento addizionale idrofobico nella catena polipeptidica ferma la traslocazione. Questo segnale di stop del trasferimento ancora la proteina dopo che la sequenza segnale dell'ER è stata rilasciata dal traslocatore e tagliata via. qui l'N-term rimane sul lato luminale della membrana e il C-term sul lato citosolico
-Negli altri 2 casi la sequenza terminale è interna, invece che all'estremità N-term. Come queste comunque la seq segnale interna è riconosciuta da un SRP che porta il ribosoma che produce la proteina alla membrana dell'ER e serve da segnale di inizio traslocazione della proteina. Dopo il rilascio dal traslocatore, la seq segnale interna di inizio trasferim resta nel doppio strato lipidico come singola alfa elica che attraversa la membrana
Le sequenze interne di inizio trasferimento possono legarsi all'apparato di traslocazione in 2 orientamenti e l'orientamento della seq di inizio trasferimento determina a sua volta quale segmento proteico (quello che segue o che precede la sequenza di inizio del trasferimento)sarà trasferito attraverso la membrana nel lume
mi interrompo un momento poi finisco di scrivere

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la_fra
Utente

betty



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Inserito il - 18 marzo 2008 : 15:04:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di la_fra  Rispondi Quotando
allora, in un caso la proteina di membrana che ne risulta ha il suo C-term sul lato luminale, nell'altro è l'N-term a essere sul lato luminale. L'orientamento della sequenza di inizio trasferimento dipende dalla distribuzione di amminoacidi carichi nelle vicinanze, una sequenza segnale interna si lega al traslocatore in modo tale che la sua estremità carica più positivamente resti nel citosol, se ci sono più AA carichi positivamente che precedono immediatamente il nucleo idrofobico della seq di inizio trasferimento rispetto a quelli che lo seguono, la seq d'inizio trasferimento è inserita nel traslocatore con un orientamento tale per cui passa attraverso la membrana la parte della proteina sul lato C-terminale della sequenza. Viceversa se ci sono più AA positivi che seguono immediatamente la sequenza idrofobica rispetto a quelli che la precedono, la sequenza si inserisce nel traslocatore in un altro modo tale per cui passa nel lume la porzione all'N-terminale della sequenza.

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netbridge85
Nuovo Arrivato

AppleTangerine

Prov.: Milano
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Inserito il - 22 marzo 2008 : 15:40:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di netbridge85 Invia a netbridge85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ohi grazie a tutti per le vostre rispostesiete stati preziosi..interrogazione in vista

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