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Autore

Discussione

sverza
Nuovo Arrivato

Città: Milano

2 Messaggi

Inserito il - 17 aprile 2008 : 09:47:19

Ciao a tutti! Sono nuovo di qui..
Sto lavorando su vari complessi proteina-ligando; cercando di calcolarne l'energia di binding, per quanto concerne il contributo entropico ho per ora usato sempre il modulo nmode di Amber. Per caso qualcuno ha da consigliarmi altri programmi per il calcolo dell'entropia?
Ciau

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Città: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 17 aprile 2008 : 15:53:44

Prova a dare un'occhiata qui, e anche agli articoli citati:

http://en.wikipedia.org/wiki/Scoring_functions_for_docking

...qualsiasi software che faccia MD e/o docking disponga di una propria scoring function: la difficolta' sta nello scegliere il pacchetto giusto col forcefield giusto, non tanto nella scoring function in se' (tanto bene o male sono tutte empiriche e aprossimate).

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada