Quanto è utile/interessante questa discussione:
| Autore |
Discussione |
|
|
pikkio
Nuovo Arrivato
Città: modena
3 Messaggi |
 Inserito il - 17 aprile 2008 : 12:42:13
|
Ciao a tutti!
Da tempo usiamo la macchina 7900HT della applied per le real time PCR da 96 pozzetti e le card da 384.
E il software in dotazione per comandare la macchina e per visualizzare i risultati, si chiama SDS, e produce files con estensione,appunto, .sds
QUesto software analizza ance i dati: si può fare uno studio di DDCt e caricare ... più piastre insieme. Il software in questo modo calcola il Ct migliore per ogni amplificato, e di conseguenza i vari DCt, DDCt, RQ, ...
MA, .. porca miseria, questo software di analisi prende solamente 10 piastre alla volta. cioè analizza al massimo 10 piastre alla volta. E capita spessissimo di avere esperimenti formati da più di 10 piastre ...
Non è possibile analizzare le piastre a gruppi di 10 perchè così calcolerà Ct diversi per gli amplificati. perchè calcolerà un Ct per il primo gruppo da 10, e un Ct per il secondo, e così via..
Quindi..la domanda è .. come fare? come fate voi con SDS o con altri software, a calcolare i Ct per i vari amplificati? a mano? ma dovrei avere sotto gli occhi tutti i grafici di tutti gli amplificati con i loro replicati per decidere quale Ct sia quello migliore per tutti loro .. una cosa un po' scomoda e complicata .. (specie se come certe volte ne ho 96 di amplificati!!).
Avete qualche idea?
Ci sarebbe un software della Applied che permette di fare più di 10 piastre alla volta .. l'"Expert" mi sembra. MA costa uno sproposito !!! perché implementa tantissime altre cose compreso un database ecc ecc .. che a noi non serve..ci serve solo potere fare studi con più di 10 piastre!!
Grazie a tutti ..
Pikkio
|
|
|
|
| |
Discussione |
|
|
|
Quanto è utile/interessante questa discussione:
| MolecularLab.it |
© 2003-24 MolecularLab.it |
 |
|
|
sds software della applied per realtime,calcolo CT
Didattica
