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pikkio
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Citt�: modena

3 Messaggi

Inserito il - 17 aprile 2008 : 12:42:13

Ciao a tutti!
Da tempo usiamo la macchina 7900HT della applied per le real time PCR da 96 pozzetti e le card da 384.
E il software in dotazione per comandare la macchina e per visualizzare i risultati, si chiama SDS, e produce files con estensione,appunto, .sds
QUesto software analizza ance i dati: si pu� fare uno studio di DDCt e caricare ... pi� piastre insieme. Il software in questo modo calcola il Ct migliore per ogni amplificato, e di conseguenza i vari DCt, DDCt, RQ, ...

MA, .. porca miseria, questo software di analisi prende solamente 10 piastre alla volta. cio� analizza al massimo 10 piastre alla volta. E capita spessissimo di avere esperimenti formati da pi� di 10 piastre ...
Non � possibile analizzare le piastre a gruppi di 10 perch� cos� calcoler� Ct diversi per gli amplificati. perch� calcoler� un Ct per il primo gruppo da 10, e un Ct per il secondo, e cos� via..

Quindi..la domanda � .. come fare? come fate voi con SDS o con altri software, a calcolare i Ct per i vari amplificati? a mano? ma dovrei avere sotto gli occhi tutti i grafici di tutti gli amplificati con i loro replicati per decidere quale Ct sia quello migliore per tutti loro .. una cosa un po' scomoda e complicata .. (specie se come certe volte ne ho 96 di amplificati!!).

Avete qualche idea?

Ci sarebbe un software della Applied che permette di fare pi� di 10 piastre alla volta .. l'"Expert" mi sembra. MA costa uno sproposito !!! perch� implementa tantissime altre cose compreso un database ecc ecc .. che a noi non serve..ci serve solo potere fare studi con pi� di 10 piastre!!

Grazie a tutti ..

Pikkio