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Città: Napoli

10 Messaggi

Inserito il - 27 maggio 2008 : 18:07:38

qualcuno sa determinare la lunghezza della 5'UTR e della 3' UTR dalla seguente "feature table"?

source 1..3180
/organism= " Caenorhabditis elegans"

gene 100..3011
/gene= ptk-2"

mRNA join (211..288,533..703,763..890,940..1024,1084..1380,1838..1962,2018..2099,2301..2456)

CDS join(250..288,533..703,763..890,940..1024,1084..1380,1838..1962,2018..2099,2301..3011)
/gene= ptk-2"
/product="protein kinase PTK2-2"

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Moderatore

Prov.: UK

1001 Messaggi

Inserito il - 27 maggio 2008 : 18:51:19

Dovrebbe essere...
5' UTR: da 211 a 250 (dall'inizio della CDS all'inizio dell'mRNA)
3' UTR: da 2456 a 3011 (dalla fine dell'mRNA alla fine della CDS)

n/a
deleted

Città: Napoli

10 Messaggi

Inserito il - 28 maggio 2008 : 14:37:21

io invece pensavo che la 5'UTR andasse da 211 a 288 e che la parte codificante di essa andasse da 250 a 288 . E'sbagliato ?

valia
Moderatore

Prov.: UK

1001 Messaggi

Inserito il - 28 maggio 2008 : 15:56:51

Non c'è una parte codificante dell'UTR (letteralmente: regione non tradotta).
La 5'UTR finisce giusto prima dell' AUG d'inizio.

http://en.wikipedia.org/wiki/5'_UTR