risalire a posiz. di inizio di un gene

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chris
Nuovo Arrivato

7 Messaggi

Inserito il - 06 giugno 2008 : 16:40:05

ciao a tutti! ho un dubbio riguardo una parte di un esercizio di bioinformatica che prevede l'utilizzo della banca dati "gene": dato un gene l'esercizio chiede di trovare gli aminoacidi dalla posizione 35 alla 38 (e fin qui ci sono)e di trovare i corrispondenti nucleotidi codificanti. Perch� si fa 35x3 MENO 2?? e invece per la posizione 38 si moltiplica semplicemente per 3 e basta?

vi ringrazio in anticipo!

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 06 giugno 2008 : 18:27:11

se fai 35x3 trovi l'ultima base del codone (ad es. ATG cade sulla G), facendo -2 cade sulla prima base (la A). La stessa cosa si deve fare per 38...forse hanno dimenticato di scriverlo...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

chris
Nuovo Arrivato

7 Messaggi

Inserito il - 06 giugno 2008 : 18:49:27

ahhhh ho capito!! ma quindi ogni volta che devo trovare la posizione iniziale del nucleotide corrispondente devo moltiplicare per 3 e sottrarre 2..? per 38 non si fa perch� essendo la posizione finale � l'ultima base dell'ultimo codone! grazie mille!!

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 06 giugno 2008 : 20:12:13

Citazione:
Messaggio inserito da chris

ahhhh ho capito!! ma quindi ogni volta che devo trovare la posizione iniziale del nucleotide corrispondente devo moltiplicare per 3 e sottrarre 2..?

sisi

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 07 giugno 2008 : 12:27:30

Mi sembra un poco mal posto l'esercizio: dato un gene, come fai a sapere qual � il punto di inizio della trascrizione, e come verr� tradotto?
Credo che la cosa pi� corretta sia retrotrascrivere la sequenza proteica e poi riallinearla con quella genomica originale, sperando che non vi siano strane duplicazioni.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

chris
Nuovo Arrivato

7 Messaggi

Inserito il - 07 giugno 2008 : 15:26:11

No, l'esercizio � molto pi� semplice di quel che sembra..non chiede di trovare il punto di inizio della trascrizione ma semplicemente di individuare gli aminoacidi dalla posizione 35 alla 38 e i corrispondenti nucleotidi codificanti..

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