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 Freeware per normalizzazione gel DGGE
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Dr.Marshall
Nuovo Arrivato



10 Messaggi

Inserito il - 16 giugno 2008 : 17:22:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dr.Marshall Invia a Dr.Marshall un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno a tutti!
Sto facendo DGGE e mi servirebbe un programma, magari freeware, per la normalizzazione dei gel e per l'analisi dei risultati..qualcuno saprebbe consigliarmi qualcosa????
Grazie a turri e buon lavoro!!

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1724 Messaggi

Inserito il - 16 giugno 2008 : 19:07:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ImageJ dovrebbe andare bene...
http://rsb.info.nih.gov/ij/
http://rsb.info.nih.gov/ij/docs/menus/analyze.html#gels
http://www.molecularlab.it//public/data/la_fra/2008321163842_quantificazione.pdf

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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Dr.Marshall
Nuovo Arrivato



10 Messaggi

Inserito il - 19 giugno 2008 : 18:06:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dr.Marshall Invia a Dr.Marshall un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie!
Lo proverò.....

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Dr.Marshall
Nuovo Arrivato



10 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2008 : 15:19:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dr.Marshall Invia a Dr.Marshall un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ho provato ImageJ ed un altro freeware che ho trovato a qusto indirizzo http://aem.asm.org/cgi/content/abstract/70/7/4390?etoc ma nessuno dei due consente la normalizzazione dei gels!
Provo a spiegarmi meglio: poichè è probabile che il gradiente dei vari gel sia diverso avrei bisogno di un programma che mi permettesse di stabilire, sulla base della diversa migrazione del marker nei vari gel, se due bande su due gel distinti sono alla stessa altezza o no! Esiste qualche freeware in grado di farlo?? MI affido a voi....
grazie
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2008 : 22:38:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Puoi usare il tool misura di ImageJ per costruire una retta di migrazione del marker e calcolare il peso della tua banda in relazione a questa.

Se hai un minimo di basi di programmazione potrai facilmente scrivere una macro in ImageJ che automatizza il calcolo.

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