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asia_1982
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
 Inserito il - 04 luglio 2008 : 17:32:01
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Ciao a tutti qualcuno mi può aiutare a trovare i primers per una NESTED PCR, RACE 3', RACE 5',RT-PCR
vi do una sequenza così potete farmi degli esempi:
GGATCCCTGT TCCTGATCAC TGATCTCTGG TTCTTTTATT ATGCATATTC 50
ATTTTGAAAT CTGATTCCTT TTCTGAGCAT GTATCAGTCT GACTAGACAC
TGAGTCCTGT CTGATTTCTG AGCCTTGGCC CTCATGAGTA AGTGACCTGC
AGTGGTGGAG GGAGCTCCAG GGGAGCCGAG ACCCTCTCAG TGCATGTACT
CACTGGTAGA TGAAGAAATG ACCCCAATGA TTGCTCCATT CTTCCAGGCT
CAGAGGGGTG TGTAGGCCCC AGGAGGACTT GGTGGGGAGA AGACCAGCCC
AGGCCCTGTG AGTACACCCA GCCCCAGCCC CTAAGGGGTC GCCAGGTCTC
GACTTAGCAC TGGGGAGGGG GTACAGTACA GGAGTGGGGA CAGGAAGGTG
AGGGGAGGCC ATGCCGTTTG TATTCTCTTG CTTTTCTCTC TCTCCTGAAG
CCTCTTGAAT AGACCTGCAG AAATACCCAA AATAGCCCTG TGGGGTGGCT 500
GAGTCATTGT GAACACAGCC CAGGTCAGGT GTTCCAGCCA GAGAACTGCT
GTTCTGAGAA ACATGCCCCA AAACCGAGAC CTGGCCAGGT GTGCCTGGGG
CCTGAGCGAG GGGCTGCAGC CACAGGTAGG CCCAGCCCCA ACCAGCCCAG
AGTCAGCTAG GGCTTTCCAG GTCCAGGGTT AGGCAGAGGT CAGCCAGGGT
CAACCACGGT CTATCTGAGG GGAGAGACAA GAGACACAGA GACATAGAGA
GAGAGAGACA GGGATGGGGA GAGACAAGAG AGACAGGAAA GGAGAGACAA
AGACAGACAC AGAGAGAGAG ATGGGGATGG AGAGAGATAA GAGACAGGGA
CAGGGAGGGA CAGAGGCGAG GCCAGTGACA GAGACAGAGT TACAAGAGAC
AGAAAGAGAG AGAGATGAGA TGAGAGAGAT CAGAAGAAAC GGAGACACAG
ATGGGAGAAA AAGAGAGGAG ATGGGAACAG GAAAAAGAGA CATGGAGACA 1000
GACATGCAGA GAGAACACAA CAGAGGCAGA GAACACACAG GGAGAGAAAG
AGGCAGCAAG ATGGGCCCAG GAACTCAGCT GCAAGCCCCT CTCACACAGT
CACTCTCACA AACACACACC ACGACTATTA TACAACATTC ACACACAAAC
ACACAGAAAC ATACCCACGC TCACAGCCAC ACACTAAGTC ACTGTCACAT
CCATACCCAC ACTCACACCC AAACACACAT GGCCCAGGAG CAAATGGGGA
GACCTCAGCC TGCAGCTGGG AGCGGCCGAG CGGGCGCTGA GCCAGAGTCG
GGGCCTGTCT GTGGGTGGGG GGCATGGCAG CACGGGCCCA CCTGCACCTA
CAAGGCCTGG CCCCCGAGGT CACTGGGCCA CCACCCAGCC CTCGCCCTGT
TCCCCGTCTG TGCTGGACGG GGCAGGACTC TGAGCCTCGG GGAAACCTAC
AGATCCACAC AGGACCCCGA ACATCGGGCT GGGGTGGGTA ACAACATGGG 1500
AGAAGCGGGA GCAGGAGGTC CCAGGACCCT GCGCACTGCG ACCCAGCCCT
GGGGGCTGAA GCCCAGGACA GCCTCAGGTC TCCCAGGAAG GACTGGACAG
TGGGGGATGG TCAGAGAACA GGACAGCCAG CAGGGTGCAG CCCGAGGACA
GGGATGGACG CTGGGAGGTC AACAGGACAG GGGCAGGGGC CGTGGAGTGG
GCGAAGGTCC TGGAGGGCCT GGAGAACCTG TGGGTCCGTG TTTGTGGGAA
GGAGGCCAGG AGCAGCCCAG AGTGGCCAGG CTGGCAGGGT GAGGAGGTGG
GGGCAGTGAG GTGAGGGTGA CCGAGACAGT GAGGCCTCTG GCCAGGGAGG
GGACCTTGGC TGGGCTCTGA CTGAACCCAG GGCTCCTGGA GAAGGGGCCC
CAGGCGGGGA TGAGGATGTG GGCATCTGAC TCCATCAACA ATGGGGCTTC
CAACACGCAC AGCCTGGGCC TCGGAGACCT GGGCCCTGAC CCGCCTCCCC 2000
CTGGCACTGG GCCGGGTGCC GTGTGTGGTC CCCAGTCCCC GCAGCACCTC
CCCCACACTG GTCACGTTCC AGGGCCCCTC TGAAGCACCT GCTGTGAGGG
GATGTGGGGA GGGGACAGGG ACTTGGGCCT GAGCTGCCGG GTCGGGGGGG
AGTCGGGGAC CCAGGCTCAG CGTGTGGCTG CGGACCAGAC AGATGGGGAT
GGAGGAGGAC ACGCCCTGTA CCCACTGCCT GCCAAGGGGC TGGACCCACG
CCCAGTATAG GCCATGTCAC CCAGAGGCCT GTGAACCATT CACTCTGAGC
CACTAAAACA TTCAGGAGCT TTGAAAGCAG CCCCCGTGCC TTGTCAATAT
GCGATGACTC TGAGCATCAC GCTGTCCCTG CTGGATCCAC CCGTCCAGCC
CCAGCGAGGG AGGCTGGGCC CCGGGCAGCA GGTGGTGAGG GCAGCGGGCA
CAGCCACCCT ACAGCACACA CAGGTCTCAG GGACGCGTCC ACCACAGCCC 2500
GTGCACAGGC TCCTCACGGC ACTGAGTTCA CCCGGGGCGC GGGCCGTTTG
TCCTCAGGAG TCCGGCTGTG CCCTCCGCCC CCAGCCCTGT CCTGCTGAGG
CTGCAGCTGG GTCCCGGGGC ACAGGGCGGC CCTGAGCACC TTGTCATGTT
GGTCCCTGTC GGGTGGGCTG CTGGCTGTCT GTGGAGCTGG CAGAGCCGCG
GTTCAGCCTT GGAGGCCGGT CCTGGGGCCC AGCAGCCGTG GGGAGCACTG
CCCAGTCCCG TGCCCACAGG GAATCACCTG GGCTGAGGAA GGGCCCACAC
GCCGACGGGA TCGGGGTCAG GCAGCGCACG CCTGGCACCG AGATCCCACG
TCCCGAAGTG GGGACACGGC CCAGGGGCAC TGTTCCGGGA GGGTCTCAAG
ATGGGGTCTC CTATTTCAAT CTTCACTCCT TCTGCACCTG TTAGCTGGGA
ACCTTCTAGA AGGAGGGGTG TCCTCAATCA TGGGGTGGTT GTGAGCTGAG 3000
CACAGATCAT GCAGGAAGGT ACATGGCTTC TCCTTCACCA GGAAAACAGT
GCAGAGAGAC AGAGACACAG AGACAGAGAC AGAGTAACAG AGAAAGAGAG
ACAGAGAGAG ACACAGAGAC AGAGACAGAG TAACAGAGAT AGACACAGAG
ACAGAGACAG AGTAACAGAG ATAGAGAGAC AGAGAGAGAC ACAGAGACAG
AGACAGAGTA ACAGAGAAAG ACAGAGAGAC AGAGACAGAG ACAGAGTAAC
AGAGATAGAG ACAGAGTCAC AGAGAGACAG AAAGAGACAG AGACAGAGTA
ACAGAGATAG AGAGACAGAG AGAGAGATAG AGACAGAGGC AGGCACAGAG
ATAAGAAAGA TACACAGAAA CAGAGAGAGA CAGAGATAGT CACTGTCACA
TTCATACCCA CGCTCACCTG CTCACACACT CACACACTCA CCTCACACTC
ACACACACTC TCACACTCAC ACACACTCAC ACAGTCACTT ACACTCACAC 3500
ACACAGTCAC ACACACACAG TCACACACAC ACTCACACAC ACACTCACAC
ACTCACACAC ACTCTCACAC ACACACTGAG CTTCCCTCAG GCCCTGTCAC
TTCCGATGGG GCCTACAGCC TGTCTAAGCC TCTGGGCCAC CAGCCCCTGG
CTCACCGGTG TGTGCCCACC ACACCCCGCC TTGGGGGTCC CCTCTATGAG
CTGGGCACAT GCCCTCCGCT CTGTTCATGG CTGGCCTGGG GGAAACAGGG
CCCACCCAAG GCCTGGCTCA GGGAAGGCCT CAAACACACA TGGCCCAGGA
GCAAAGGGGC AGAGCTCAGC CTGCAGCTGG GAGCGGGCAG GGGTAGTGGA
GTGGGCGGAG GGCCTGGAGA ACCTGCAGGG CTCCGATGTC TCTGGGAAGG
GGGCCCAGGA GCAGCTCAGC GTGGCTGGGC CGGCAGGGGC GAGGAGGTGG
GGGCCGTGAG GGAGGGGTGA CTCGGCTGTG TGGGGTGCCG GGGGACACGG 4000
GCTTTGCTCC GGCTGAGCCC AGGCAGTGGC GAATCCCTGA GCTGCCAGGA
GGAGAGCAGG GCCGGGGTCA GGCAGAGGTG GGCCGCGGGG CCGAGGGCTG
CGGCCGGTCG GGAGCAGTCG GTCGGTTGAG GGCACCATTA CATGGAGGGC
TGTGAGACGG GAGACCCCAT TCCCTTCATT CCTTGTGCAC GTGTTAGTGA
GAAGCTTCTA GAAGGAGGGC ATTGCTCGTA GTGGGTGAGT GTGAGCACAG
ATCATGCAGG CTGGCGTGCT GCCGTGAAGT GCCTCTCTTT ACTTTCCAGA
CCTCAGCATG GCAAGCCCGT CCTGTGCCCC AGGGTCTTTC TGGAGTACAC
GCCGCGCGGT CCTGGTGGGC ACCATACCTG GCACCCACGC TTTGGCCGGG
CCCGAACCTT GCGCCCTCCC AGCCCCCATG TGGCTCTCCC TTGGCCATAC
TGGCCTTTTG CCAGTCCTCC TACCTCACCC TAGGGTCTGC CTGGCCCTGC 4500
CCTCCCTTCC TAGCCCCCCA AGGAGGCTGG AGGGCACCCC TGCGTCCACC
AGCAGCAGCT CCTCATGGGC GAGTCTCCTT TGGGCCAGTG ACACATAGTG
TGCCCCGATG GTGCCACGGC AGCCTGGGCC CTCCGCCTTC CTGCTTGGCA
GGCACCCCCG CTCCCTGCAC CCTCACCGGG GCACCTGTGA GCCCTGAGGG
CCAGTGGGGG TCTCACTGCT GCTCCCTCCC ACAGCCTAGC CTCGGGCCTC
AGGGCTCTGC ATCCAAGCGG CCCAGGGCTC CCTGAGGTCT CAGCCCGAGT
GGGCCTTTGA GCCTTCGCGT TCTCTGCAGG GTGGGACCTG CCCAAGGGCT
GCTGAGGGCT TCCCAGGGGT CCTGTGGGTC CCACCTAGGG GCAAGCTGGT
GAGGAAAGTG GGTCCTGCCA TGGCGGCCGG GTGGGCTGAG TTTTCGGCAT
CTCTGGGCCC AACAGCAGGT CCCTGGAGCG GCGCCCACCC CTCCCCCAGG 5000
CAGGTGTGAG GGCTCTGATC TGTTTCTCCT TGAGTGACTC ATTCTGGGCA
GACTTGGCCC TCAGGGCACA TGCAAATGGT TGTTTGTTCC ACACCGAAAA
CATGTTTCTC GCCCTCTGAG GCTGTTTCCA GAAATAGCTT GCACGATTCT
CCCGCCCCCT CCCCCAGCGT GGCCAGGCTG GCTCAGGCCT CCAGATTCGG
GGACACCCCC CCACCACAGC GTGGCCAGGC TGGCTCAGGC CTCCAGATTC
GGGGACACCC GCCCCCTCCC CCAGGACAGG CCCACTTGGG TTACTGACAC
TGGACCACCC TGCAAACGTC AACTTAATGA ATTCAGTGGT TCTGAACTTG
TTGCCATCTT TGGGACCAGG ACCCAGGGGC AGCCCCCAGG TTGGCAGGAA
GGGC 5404
Allegato:  Sequenza_Amplic_5404bp_[1].doc
41,95 KB
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asia_1982
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 05 luglio 2008 : 14:27:00
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| ragazzi....è importante ho l'esame di ing genetica tra 3 giorni....cercate di rispondere!!!!!!!! |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
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asia_1982
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 06 luglio 2008 : 18:00:25
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| si ho visto ma io devo cercarli manualmente....in pratica il prof. ci da un genoma o una parte e ci chiede quali secondo noi potrebbero essere primers per una PCR NESTED, PER UNA PCR INVERSA,RACE 3' E PER UNA RACE 5'.......???????? |
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Cangrande
Utente Junior
Prov.: Verona
280 Messaggi |
Inserito il - 06 luglio 2008 : 22:10:29
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Dal tuo file vedo che vuoi primers:
- da 22mer
- 55% di contenuto in GC
- 3' in G o C
giusto?
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Magnifico atque victoriosissimo Domino, Domino Kani Grandi de la Scala. |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 07 luglio 2008 : 00:08:13
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E all'esame danno questi esercizi senza aver spiegato nulla a lezione???
Comunque qua trovi (pg. 13-16) le caratteristiche dei primers:
Polymerase chain reaction e sue applicazioni
devi scegliere le sequenze e calcolare le T di melting
Qua trovi una esercitazione simile a quello che devi fare:
Esercitazione protocollo PCR
Comunque devi trovare i primers per la PCR inversa o per la RT-PCR?
Citazione:
Messaggio inserito da asia_1982 - 04 luglio 2008 : 17:32:01
Ciao a tutti qualcuno mi può aiutare a trovare i primers per una NESTED PCR, RACE 3', RACE 5',RT-PCR
Citazione:
Messaggio inserito da asia_1982 - 06 luglio 2008 : 18:00:25
..in pratica il prof. ci da un genoma o una parte e ci chiede quali secondo noi potrebbero essere primers per una PCR NESTED, PER UNA PCR INVERSA,RACE 3' E PER UNA RACE 5'.......????????
comunque quella è una sequenza di DNA... RT-PCR, RACE 3' e RACE 5' si fanno su RNA.
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asia_1982
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 07 luglio 2008 : 09:58:19
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| ok...vi ringrazio!!!!Si io ho dato una seq. per fare capire lui che tipo di esercizio ci dà. No a lezione è stata spiegata solo la PCR "semplice" perchè è cambiato il prof. ma ora ci hanno detto che all'esame ci sarà quello precedente....che chiede questa roba!!!! |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
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asia_1982
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 07 luglio 2008 : 12:33:13
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| Grazie mille!!!! |
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