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phageman
Nuovo Arrivato

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Inserito il - 27 dicembre 2005 : 18:03:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di phageman Invia a phageman un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
io ho ristretto del dna fagico con enzimi di restrizione e dopo corsa elettroforetica su gel di agarosio 1% con un marker ad alto peso molecolare (Hind III), voglio calcolarmi il peso molecolare delle bande. ma come fare? qulacuno di voi sa come fare?

chick80
Moderatore

DNA

Cittā: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 27 dicembre 2005 : 23:42:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma vuoi il peso molecolare o la lunghezza?
Cmq:

Ovviamente se non hai la sequenza delle basi ti dovrai accontentare di qualcosa tipo:
PM = [(Ax312.2) + (Gx328.2) + (Cx288.2) + (Tx303.2) - 61.0]
PM = 307.7 * numero di basi (307.7 e' la media dei pesi della formula sopra)

Se vuoi sapere il peso (prima di far correre il gel) fai una lettura a 260 e hai
1 OD260 = 33ug DNAss
1 OD260 = 50ug DNAds

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phageman
Nuovo Arrivato

Prov.: Padova


2 Messaggi

Inserito il - 28 dicembre 2005 : 09:54:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di phageman Invia a phageman un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
il fatto č che nn si conosce la sequenza e quindi nn so la quantita di a g c t. io pensavo di calcolarmi la distanza delle bande del marker dal pozzetto e farmi un grafico e poi tramite una retta di regressione calcolarmi i pesi delle bande di restrizione calcolando la distanza dal pozzetto.
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chick80
Moderatore

DNA

Cittā: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 28 dicembre 2005 : 10:32:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No asp... cosi trovi la lunghezza non il peso molecolare!
E ricorda che devi fare un grafico semilogaritmico o non funziona!

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selenaddict
Nuovo Arrivato



60 Messaggi

Inserito il - 09 ottobre 2015 : 12:42:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di selenaddict Invia a selenaddict un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
in questo momento mi sfugge ma potreste spiegarmi cos'č quel -61.0? , questa formula ovviamente č riferita a ssDNA ?
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