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PrincipessaEly
Nuovo Arrivato

almu
Prov.: TO
Cittā: Torino


7 Messaggi

Inserito il - 17 luglio 2008 : 08:22:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di PrincipessaEly Invia a PrincipessaEly un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,
qualcuno saprebbe dirmi quali siano, in ordine, i passaggi del sequenziamento gerarchico? E da cosa differisce rispetto allo shotgun?
Grazie 1000.

Patrizio
Moderatore

mago

Cittā: Barcellona


1912 Messaggi

Inserito il - 18 luglio 2008 : 07:55:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
per il sequenziamento gerarchico
1)isolare i cromosomi
2)frammentare e fare delle library anche con diversi vettori
3)assemblare i contig
4)shotgun per ogni singolo clone
5)congiungere i cluster tenendo anche come riferimento le mappe genetiche,sts,sslp etc....etc..

Per il sequenziamneto shotgun
1)frammentare il genoma
2)fare una library con vettori fagici
3)sequenziarlo
4)overlappare i frammenti ovviamente tenedo conto dei dati usati trovati dagli altri come ha fatto Venter per le mappe,con genomi di organismi superiori


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PrincipessaEly
Nuovo Arrivato

almu

Prov.: TO
Cittā: Torino


7 Messaggi

Inserito il - 21 luglio 2008 : 14:30:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di PrincipessaEly Invia a PrincipessaEly un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie, gentilissimo!!
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