Ciao a tutti, qualcuno saprebbe dirmi quali siano, in ordine, i passaggi del sequenziamento gerarchico? E da cosa differisce rispetto allo shotgun? Grazie 1000.
per il sequenziamento gerarchico 1)isolare i cromosomi 2)frammentare e fare delle library anche con diversi vettori 3)assemblare i contig 4)shotgun per ogni singolo clone 5)congiungere i cluster tenendo anche come riferimento le mappe genetiche,sts,sslp etc....etc..
Per il sequenziamneto shotgun 1)frammentare il genoma 2)fare una library con vettori fagici 3)sequenziarlo 4)overlappare i frammenti ovviamente tenedo conto dei dati usati trovati dagli altri come ha fatto Venter per le mappe,con genomi di organismi superiori