ciao vorrei capire quanti pg di dna posso trovare in 100 mL di acqua. ho letto che posso trovare anche fino a 400 ufc di batteri vari non pericoloso senza contare i virus. qualcuno me lo dire? è possibile magari con una estrazione con beads magnetici e poi una lettura con un cromoforo fare questa misura? grazie
Premetto che non so rispondere a nesuuna delle tue due domende...
Però ti posso dire che, in condizioni normali di igienicità, a volte si superano i valori di 400 ufc/100 mL, in particolare nell'acqua proveniente dagli acquedotti. Nelle acque "microbiologicamente pure", cioè quelle minerali si possono comunque trovare batteri non patogeni, anche se in quantità minore.
In caso di problemi o contaminazioni (non così infrequenti come si potrebbe pensare) i coliformi e le pseudomonadaceae possono superare tranquillamente questi valori.
Non ti so dire come misurare la quantità di DNA, però forse filtrando grandi quantità di acqua si può arrivare ad ottenere un numero di cellule sufficienti per un'estrazione con Kit
dopo un po di ricerche ho trovato una pubblicazione che riporta uno studio (negli usa) sulla concentrazione di dna in acqua di rubinetto. alla fine si capisce che si piò trovare fino a 1ng. il metodo è laborioso e si conclude con una lettura in fluorescenza partendo da 25-50 mL. più facilmente si può fare l'estrazione sui beads e apllicare un reaativo che produce segnale al microluminometro. altrimenti in rt-pcr col sybr green , ma non so bene che primer si possa usare ?!?!