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Kirian
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 08 settembre 2008 : 16:15:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Kirian Invia a Kirian un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao sono ai miei primi passi con il programma Pymol e voglio utilizzarlo per fare una breve lezione a dei ragazzi delle medie sul DNA. Sto cercando (già pronta) la doppia elica di Dna. per caso qualcuno mi sa dire dove posso scaricarla già fatta?
esistono dei data base per chi sta imparando?

grazie mille
Fra

RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 08 settembre 2008 : 16:55:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao,

potresti cercare una sequenza su PDB, come questa:

http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1QC1

e fare un'immagine come questa (si possono fare molte piu cose...)



Immagine:

67,4 KB

se hai bisogno chiedi pure!

ps: immagino sia molto difficile spiegare il DNA a ragazzi delle medie, penso che sui loro libri ci siano degli schemi del DNA molto piu comprensibili...
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Kirian
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 09 settembre 2008 : 10:21:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Kirian Invia a Kirian un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
GRAZIE!!
ora ci provo.
è vero, sui libri ci sono un sacco di schemi, ma utilizzare un supporto informatico mi aiuta ad attirare l'attenzione e mi permette di "manipolare" la molecola al momento per sottolineare meglio alcuni dettagli. L'unico grosso problema è che io non sono molto informatizzata e Pymol è veramente difficile!!! Non esiste un tutorial semplice in italiano per imparare ad usarlo?
comunque grazie mille!!
Fra
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Kirian
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 09 settembre 2008 : 10:37:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Kirian Invia a Kirian un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ho provato ma l'estensione non va bene.. come si fa a convertirlo?
scusate l'ignoranza
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 09 settembre 2008 : 11:03:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao, allora per scaricare il file da aprire con pymol devi fare cosi:



Immagine:

49,41 KB

dopo averlo scaricato lo puoi aprire con pymol. Quando lo apri però non ti viene rappresentato come ho messo io nell'immagine, quindi io ti consiglio di fare cosi:

- nascondere tutto ciò che ti viene rappresentato all'inizio:



Immagine:

46,34 KB


- mostrare tutto come "cartoon":



Immagine:

44,71 KB
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 09 settembre 2008 : 11:06:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Penso che questa discussione andrebbe spostata nella sezione di bioinformatica... grazie
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RNA world
Utente Junior

dna



370 Messaggi

Inserito il - 10 settembre 2008 : 22:05:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RNA world Invia a RNA world un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao,

questo è un esempio di video molto molto semplice che è possibile fare in 10 minuti con pymol.

La qualità non è delle migliori, per diversi motivi:

- uso di pochi frames per la creazione del filmato

- uso di windows movie maker per montare le immagini (frames)

- ho creato un file di soli 100 kb per poterlo caricare velocemente sul forum..

ciao



Allegato: dnaex.zip
91,03 KB
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Kirian
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 11 settembre 2008 : 09:24:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Kirian Invia a Kirian un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie mille!
ce l'ho fatta!!
la prossima domanda/risposta la metto in Bioinformatica
Fra
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