| Autore |
Discussione |
|
|
Luis 22
Utente
Città: Bari
755 Messaggi |
 Inserito il - 24 gennaio 2006 : 18:56:08
|
Ecco per la terza volta questo famoso topic!
Sto cercando informazioni riguardo ad alcune tecniche applicate alla diagnosi di malattie genetiche:
- ARMS (Amplification Refractory Mutation System) applicata alle patologie autosomiche recessive
- OLA applicata sempre alle patologie autosomiche recessive
- Multiplex PCR applicata alle patologie X-linked recessive
- MLPA (Multiplex Ligation dependent Probe Amplification) sempre applicata alle patologie X-linked recessive
Aggiungo un altro dubbio, comunque collegato alla diagnosi: cos'è il pittogramma?
|
 
La vita e i sogni sono fogli di uno stesso libro. Leggerli in ordine è vivere, sfogliarli a caso è sognare. (Arthur Schopenhauer)& |
|
|
|
|
Luis 22
Utente
Città: Bari
755 Messaggi |
Inserito il - 25 gennaio 2006 : 13:53:21
|
| E aggiungo ancora un'altra tecnica: il PTT. Di questa proprio non ho trovato niente! |
La vita e i sogni sono fogli di uno stesso libro. Leggerli in ordine è vivere, sfogliarli a caso è sognare. (Arthur Schopenhauer)& |
 |
|
|
Vincent
Nuovo Arrivato
Prov.: Bari
Città: Putignano
3 Messaggi |
 Inserito il - 27 gennaio 2006 : 17:43:51
|
La definizione di pittogrammi come tecnica diagnostica dovrebbe riguardare l'analisi di eventuali errori di splicing...e dovrebbe essere un garfico x cui x ogni base esiste un numero che dà una percentuale della presenza della base stessa. Ma non ne sono sicurissimo.
Ank'io vorrei saperne di più!!!
E possibilm a breve visto che per me l'esame incombe! 
Grazie. |
Scienziato non è colui che sa dare le vere risposte, ma colui che sa porre le giuste domande
(Strauss) |
|
|
|
chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 27 gennaio 2006 : 23:45:57
|
Purtroppo non conosco le tecniche nello specifico.
Credo che questo libro potrebbe aiutarti (magari lo riesci a trovare in biblioteca in universita!)
Ho visto che c'e' un capitolo sull'ARMS e varie cose sulla diagnostica. |
Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui
My photo portfolio (now on G+!) |
|
|
|
Luis 22
Utente
Città: Bari
755 Messaggi |
Inserito il - 27 gennaio 2006 : 23:53:58
|
Ti ringrazio, anzi ti ringraziamo!  |
La vita e i sogni sono fogli di uno stesso libro. Leggerli in ordine è vivere, sfogliarli a caso è sognare. (Arthur Schopenhauer)& |
|
|
|
emanuele83
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
|
|
Luis 22
Utente
Città: Bari
755 Messaggi |
Inserito il - 06 febbraio 2006 : 22:44:47
|
Grazie!
|
La vita e i sogni sono fogli di uno stesso libro. Leggerli in ordine è vivere, sfogliarli a caso è sognare. (Arthur Schopenhauer)& |
|
|
|
buffymat
Nuovo Arrivato
45 Messaggi |
Inserito il - 23 febbraio 2008 : 13:44:57
|
| Ma mutazioni e SNP (single nucleotide polymorphism) sono la stessa cosa? gli snp che sono? sono naturali? |
|
|
|
Luis 22
Utente
Città: Bari
755 Messaggi |
Inserito il - 23 febbraio 2008 : 13:57:46
|
Allora, gli SNP sono i più diffusi polimorfismi (e non mutazioni) del genoma e come dice il nome stesso, sono sostituzioni in singoli nucleotidi.
Rappresentano lo 0,1% del genoma (3-10 milioni di pb) e sono circa 1/500 - 1/1250 pb.
Solo l'1% di questi è definito codificante, cioè cambiano la sequenza aa codificata. Gli altri sono o non codificanti o sinomini, cioè cadono in terza base, senza variazione amminoacidica.
Gli SNP sono molto studiati nella farmacogenomica, dove possono essere responsabili delle variazioni interindividuali alla risposta ai farmaci.
|
La vita e i sogni sono fogli di uno stesso libro. Leggerli in ordine è vivere, sfogliarli a caso è sognare. (Arthur Schopenhauer)& |
|
|
|
giusy602
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
Inserito il - 23 febbraio 2008 : 18:59:07
|
Allora il PTT (protein truncation test) serve per identificare mutazioni nonsenso, frameshift, quando la mutazione determina la produzione di una proteina tronca. Si può amplificare DNA genomico o cDNA. Si usano primers di amplificazione con sequenze riconoscibili dal sistema di trascrizione/traduzione in vitro. Il frammento amplificato viene così tradotto in proteina. La proteina viene sintetizzata in presenza di metionina radioattiva e il risultato viene visualizzato mediante SDS-PAGE e autoradiografia. Se è presente la mutazione il risultato sarà assenza della banda corrispondente alla proteina d'interesse.  |
|
|
|
cin
Utente Junior
Prov.: Padova
Città: Padova
558 Messaggi |
Inserito il - 28 febbraio 2008 : 08:55:44
|
Dalle diapo di un corso avanzato di bilogia molecolare del San Raffaele:
OLA: Metodi basati su enzimi DNA LIgasi.Si impiegano coppie di oligo nucleotidi probe che si legano alle seq. complementari target l'uno adiacente all'altro e recano estremità 5' o 3' allele-specifiche nel punto di giunzione fra i probe. Quando i probe sono perfettamente appaiati alla seq. target vengono riuniti da una DNA ligasi, mentre la presenza di un misappaiamento alla giunzione impedisce la ligazione.
ARMS: Metodi basati su enzimi DNA polimerasi- primer extension. Si disegnano 2 primer allele-specifici, che terminano con la base in 3' complementare alla seq wt o alla mutata. Questi primer vengono fissati al supporto del microarray e vengono ibridati con il filamento complementare del prodotto precedentemente amplificato dal campione in esame con primer esterni alla base variante. La DNA polimerasi estende il primer allele-specifico solo quando l'estremità 3' è perfettamente complementare al templato, incorporando nucleotidi di cui uno è marcato con fluorescenza. Dal fatto che si generi o meno un prodotto fluorescente si può dedurre il genotipo del campione in esame. Si può fare anche su gel d'agarosio.
Un lavoro è: Pastien T et al.Genome research 10:1031-1042,2000 |
|
|
| |
Discussione |
|
Tecniche per la diagnosi di malattie genetiche
Didattica e Relazioni
