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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1912 Messaggi |
 Inserito il - 16 luglio 2011 : 20:12:57
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non so se ci sia un'esperto o se ci vuole un'esperto per capire..., comunque stavo cercando la posizione di un gene e nelle banche dati mi esce questa cosa, io so che si trova sul cromosoma 2 , ma nelle banche dati trovo questo:
Chromosome: FBgn0003520
Map position: 55B5-55B7|2-83.5 cM
cosa significa FBgn0003520
e la map position visto che è in cM , rispetto a cosa?
grazie
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 17 luglio 2011 : 02:08:08
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FBgn0003520 è l'ID del gene assegnato dal database fly base, FB sta appunto per Fly Base.
Per spiegarti la map position forse è meglio se ti faccio un breve riassunto di come sono suddivise le regioni dei cromosomi di Drosophila.
Innanzitutto la Drosophila ha 4 cromosomi: X, 2, 3 e 4
I cromosomi 2 e 3 presentano 2 bracci, L (= left) e R (= right), quindi spesso i cromosomi sono indicati considerando i 2 bracci, quindi: X, 2L, 2R, 3L, 3R, 4
la numerazione delle regioni inizia dal cromosoma X e finisce con il 4 come se fossero un continuo, quindi le regioni da 1 a 20 sono su X, poi continuano in 2L ... ecc (non é difficile ricordarsele perché vanno di 20 in 20, sono 20 per ogni braccio cromosomico e solo 2, 101-102, sul cromosoma 4 che è molto piccolo)
ogni regione è suddivisa in sottoregioni indicate con le lettere dell'alfabeto e in sotto-sottoregioni indicate ancora con numeri, quindi avrai ad es: 1A3, 53B1...
Tu hai ad es. che il tuo gene si trova in "55B5-55B7", quindi nella regione 55 sottoregione B da 5 a 7. Sapendo che le regioni 41-60 sono localizzate sul cromosoma 2R, sai che il tuo gene è su 2R.
L'altro numero che trovi dopo è un altro metodo per mappare il gene, "2-83.5 cM"
2 perché si trova sul cromosoma 2
83.5 cM è la posizione dall'inizio del cromosoma.
(lo so è enorme la figura, ma da qui non posso ridurla, poi metterò la versione ridotta) |
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1912 Messaggi |
Inserito il - 17 luglio 2011 : 09:46:56
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52,11 KB
Lasciala stare grande ...si vede meglio :)
grazie angor ..ora che vengo a Milano ti offro un caffè e cornetto |
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