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valeriamassa
Nuovo Arrivato


Prov.: Milano
Città: milano


64 Messaggi

Inserito il - 11 gennaio 2007 : 13:37:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di valeriamassa  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di valeriamassa Invia a valeriamassa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,mi è sorto un dubbio atroce: ho tagliato un vettore con ecor1, ho tagliato il mio inserto con ecor1 e ho defosforilato il mio vettore. Quando defosforilo quanti gruppi fosfato elimino? Ne elimino due per ogni molecola di vettore? E allora quando ligo l'inserto questo riporta i gruppi fosfato necessari? a me non tornano tanto i conti..

valeria

RM
Nuovo Arrivato



115 Messaggi

Inserito il - 11 gennaio 2007 : 19:16:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RM Invia a RM un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sì, l'inserto fornisce i fosfati necesssari per ligare l'inserto al vettore a due estremità. Gli strand opposti rimarranno con due nicks che verranno riparati da E.Coli dopo la trasformazione
Ciao
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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 11 gennaio 2007 : 21:50:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Non ti tornano i conti giustamente: infatti due nicks rimangono sempre
e comunque all'interno del plasmide ligato (prodotto finale) dopo una
defosforilazione delle sue estremità.

L'inserto porta sì due gruppi fosfato, ma questi vanno a legarsi
alle estremità 3' libere del plasmide, mentre quelle 5' -defosforilate-
rimangono tali anche nel prodotto finale: 2 su 4 legami fosfodiesterici
non avvengono, per questo rimangono 2 nicks(uno per filamento)

Quando lo feci notare ai miei tutors, ai tempi dei laboratori
didattici, questi ci rimasero di sasso, ammettendo che non ci
avevano mai pensato prima (e chissà quante ligazioni avevano
fatto senza saperlo ...). Cmq mi dissero che questa cosa non
è di impedimento alla cellula che incorporerà il plasmide,
perchè esistono meccanismi enzimatici adatti per far fronte
a questo tipo di problema (nucleotide chinasi, ad esempio).

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

Less Jim Morrison, more Sean Morrison!


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valeriamassa
Nuovo Arrivato


Prov.: Milano
Città: milano


64 Messaggi

Inserito il - 14 gennaio 2007 : 10:27:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di valeriamassa  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di valeriamassa Invia a valeriamassa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie davvero a tutti e due, mi avete confortato molto perchè pensavo di essere stupida anche solo a pormi il problema...Grazie ancora,
vale

valeria
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