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 Protocollo T4 DNA ligasi Takara
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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi

Inserito il - 17 gennaio 2007 : 16:12:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Carissimi..qualkuno utilizza la T4 DNA ligasi della Takara? In tal caso potreste darmi il protocollo relativo? Nello sheet del prodotto nn se ne fa menzione..tanto meno sul catalogo ke ho qui in laboratorio..fino ad ora ho lavorato con la T4 della fermentas ke agisce incubando 1h a 22°C e disattivando x 10 minuti a 65°C ma nn credo vada bene anke x l'enzima Takara.

Bacioni..e grazie.

Farah

GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 18 gennaio 2007 : 17:10:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Mah? Secondo me non ci dovrebbero essere differenze tra i protocolli di T4 DNA ligasi di diverse case.
Sul protoccollo della mia T4 DNA ligasi c'e scritto di utilizzarla:
1 h a 23-26°C per Cohesive Ends
16-24 h a 14°C per Blunt Ends


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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi

Inserito il - 18 gennaio 2007 : 17:14:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie..ma secondo me dipende dalla marca..solitamente ci sono delle restrizioni di questo tipo.

Farah
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AleXo
Moderatore

OrniAle

Prov.: Estero
Città: San Francisco, California


1550 Messaggi

Inserito il - 18 gennaio 2007 : 23:24:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AleXo  Invia a AleXo un messaggio AOL Invia a AleXo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
io della takara usavo il ligation kit (provati sia il .1 che .2)... andavo sempre sul sicuro: 16° O/N.

(a volte, per sticky ends, scaldavo sui 60 il mix di DNA, poi raffreddavo in ghiaccio e aggiungevo la T4)

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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi

Inserito il - 20 gennaio 2007 : 12:42:47  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io ho preso l'enzima ed il buffer...il kit in cosa consiste?

Farah
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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi

Inserito il - 27 gennaio 2007 : 21:08:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Inoltre...è possibile ke abbia un problemino di diluizione..cioè il mio enzima è 350U/microlitro..x una ligasi di solito si usano da 1 a 5 U in una reazione..ciò vorrebbe dire diluire di un casino di volte la mia ligasi...ma se invece lavorassi senza la diluizione..oltre ke (ovviamente) sprecare + enzima..cosa potrebbe accadere alla reazione?

Farah
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DOCTOR G
Nuovo Arrivato

occhio



11 Messaggi

Inserito il - 28 gennaio 2007 : 12:53:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di DOCTOR G Invia a DOCTOR G un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ti va in saturazione la reazione, ma sprechi solo l'enzima. Cmq il protocollo non dovrebbe variare da marca a marca. Prova solo a diluire, la concentrazione iniziale mi sembra eccessiva...
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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi

Inserito il - 28 gennaio 2007 : 17:23:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
E se anke la reazione va a saturazione...mica vuol dire ke il frammento nn si inserisce? Perkè mil dubbio è...in cosa devo farla questa diluizione?

Farah
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