Evidenziare ECD da sequenza proteica

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nemoz18
Nuovo Arrivato

8 Messaggi

Inserito il - 19 ottobre 2012 : 10:36:17

Ciao a tutti!
avendo la sequenza di questo recettore: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/50978988
come faccio ad evidenziare la ECD? la parte extracellulare?
una volta ottenuta ci sono programmi di predizione della struttura secondaria?
grazie a tutti!

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 19 ottobre 2012 : 11:10:58

Il file GenBank di cui hai postato il link contiene gi� diverse informazioni riguardo la suddivisione della proteina in regioni e domini annotati.

Per quanto riguarda la predizione di struttura secondaria c'� solo l'imbarazzo della scelta. Giusto per citare i pi� famosi:

http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-jpred/
http://compbio.soe.ucsc.edu/SAM_T06/T06-query.html
http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/
http://download.igb.uci.edu/sspro4.html
http://www.aber.ac.uk/~phiwww/prof/

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

nemoz18
Nuovo Arrivato

8 Messaggi

Inserito il - 19 ottobre 2012 : 11:45:08

grazie mille