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Autore

Discussione

Geeko
Utente

Citt�: Milano

1043 Messaggi

Inserito il - 09 novembre 2012 : 16:20:25

Nell'articolo che sto leggendo nella descrizione di un saggio EMSA viene riportato:

Citazione:
Binding was competed by a 50-fold molar
excess of the same unlabeled fragment but not by a
similar amount of a different fragment, thus showing
the specificity of the interaction.

Mi pare di capire che abbiano usato nella stessa incubazione frammenti di DNA (un promotore in questo caso) marcati e non marcati - questi ultimi concentrati 50 volte pi� dei primi. Quindi ci sar� un competizione dei frammenti per il fattore di trascrizione aggiunto. Cio� in questo caso la specificit� del legame viene provata da fatto che il fattore di trascrizione andr� a legare anche (mi viene da dire addirittura) quei pochi frammenti marcati?
E' meglio usare questa strategia o mettere altri frammenti casuali nel mix?

0barra1
Utente Senior

Citt�: Paris, VII�me arrondissement

3847 Messaggi

Inserito il - 09 novembre 2012 : 16:26:29

A me pare di capire che abbiano effettuato due esperimenti:

- binding con frammento A marcato + 50X frammento A non marcato
- binding con frammento A marcato + 50X frammento J non marcato

La specificit� viene dal fatto che il segnale si riduce solo nel primo caso, indicando che altri frammenti non competono con A per il legame e cio' suggerische che quest'ultimo interagisca specificamente con il fattore di trascrizione in esame.

Che ne pensi?

So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss

Geeko
Utente

Citt�: Milano

1043 Messaggi

Inserito il - 09 novembre 2012 : 16:37:28

Ecco, ora torna. Era quel "competed" che mi fuorviava...io lo intendevo come "� stato fatto competere" invece il legame ha subito la competizione con i frammenti non marcati.
Frainteso l'inglese, concordo
grazie