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Slipknot77
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 11 aprile 2013 : 12:53:56

Ciao a tutti,
devo valutare, tramite analisi bioinformatica (MuPro dovrebbe essere il software cge fa al caso mio) una sostituzione amminoacidica nell'esone 31 del gene COL3A1 che produce la proteina del collagene III catena alpha1. In particolare, devo capire se questa sostituzione pu� influire sulla stabilit� della struttura proteica. Oltre a MuPro conoscete altri software che possono fare al caso mio? Quelli che ho preso in considerazione come primo step mi dicono di inserire un PDB(protein data bank)code ma, ho capito che la struttura del COL3A1 non � stata ancora depositata..

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 11 aprile 2013 : 16:11:47

scusa l'ignoranza ma cos'� un software cge?

Tu parli di caratterizzare una mutazione singola su un modello, visto che non c'� cristallo o NMR.

Sar� scettico ma, o questa mutazione � veramente critica o vedrai ben poco pure con la SVM pi� addestrata che c'�.

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada