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Autore Discussione  

jeje
Nuovo Arrivato



52 Messaggi
Inserito il - 19 luglio 2010 : 15:20:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di jeje Invia a jeje un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti ,mi sapete dire come faccio a discriminare nella sequenza mRNA esoni da introni?volendo disegnare primer che stiano a cavallo tra i due?
io uso NCBI--nucleotide manon mi fornisce una posizione precisa degli introni..
grazie mille

darkene
Utente Junior

occhi



291 Messaggi
Inserito il - 26 luglio 2010 : 12:47:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di darkene Invia a darkene un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
se guardi un mRNA non troverai mai gli introni. quelli li trovi se cerchi il gene, quindi sul genomico. ti consiglio di andare su ensembl che č pių facile.
ciao
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jeje
Nuovo Arrivato



52 Messaggi
Inserito il - 28 luglio 2010 : 15:26:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di jeje Invia a jeje un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
pensavo fosse mrna immaturo..
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jeje
Nuovo Arrivato



52 Messaggi
Inserito il - 28 luglio 2010 : 15:35:37  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di jeje Invia a jeje un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ok ho capito grazie
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cami
Utente Junior

p

Cittā: roma


136 Messaggi
Inserito il - 02 agosto 2010 : 12:22:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cami Invia a cami un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
se cerchi su NCBI nucleotide dovresti vedere la sequenza del gene, non dell'mRNA, in quel caso vengono indicati anche gli esoni...
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GFPina
Moderatore

GFPina

Cittā: Milano


8408 Messaggi
Inserito il - 02 agosto 2010 : 12:33:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da cami

se cerchi su NCBI nucleotide dovresti vedere la sequenza del gene, non dell'mRNA, in quel caso vengono indicati anche gli esoni...

Su NCBI nucleotide hai le sequenze "nucleoticdiche" quindi sia di DNA che di RNA, dipende poi da cosa selezioni:
- se selezioni una sequenza con scritto "genomic" sarā la sequenza del DNA genomico
- se selezioni "mRNA" sarā appunto la sequenza dell'mRNA
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Manolis
Nuovo Arrivato



16 Messaggi
Inserito il - 22 agosto 2010 : 19:42:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Manolis Invia a Manolis un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
io ti consiglio "genome browser" trovi la genomic sequence e di lā puoi filtrare per avere tutti gli esoni con una parte intronica... č molto carino!

CiaoM
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Manolis
Nuovo Arrivato



16 Messaggi
Inserito il - 23 agosto 2010 : 10:11:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Manolis Invia a Manolis un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
poi nello stesso sito puoi fare un blast per vedere se i tuoi primer sono univoci (blast) e se vuoi usa anche "https://ngrl.manchester.ac.uk/SNPCheckV2/snpcheck.htm" per vedere se si allineano in una regione dove ci sono snp... quindi problemi :-)

ciaoM
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