Salve a tutti Mi potete dire perchè è importante eliminare ogni traccia di rna prima della pcr?? non dovrebbe dare fastidio alla polimerasi. Al massimo qualche appaiamento aspecifico, ma non può essere incorporato o usato come primer. Posso capire che dia fastidio nel sequenziamento, ma in un protocollo raccomandava di eliminarlo prima della pcr.
Penso che sia perchè frammenti di RNA potrebbro appaiarsi al DNA stampo e quindi ostacolare l'avanzamento della polimerasi; infatti se l'enzima trova un frammento, si blocca. Oppure lo stesso RNA ibridato può diventare accidentalmente un primer: gli inneschi di RNA vengono utilizzati dalla natura per sintetizzare l'elica non senso. Ora queste sono solo mie opinioni, per cui prendile "con le molle"..
SI infatti, penso sia proprio perchè l'appaiamento aspecifico di rna possa impedire alla polimerasi di replicare. Che vengano usati come primer i filamenti di rna non penso, le polimerasi utilizzate non ne sono capaci. Grazie per la risposta, ciao.