Proteine artificiali

Sofisticati algoritmi consentono di simulare il processo di ripiegamento della catena di aminoacidi

Usando sofisticati algoritmi su normali computer desktop, alcuni ricercatori dello Howard Hughes Medical Institute hanno progettato e costruito una nuova proteina funzionale che non si trova in natura. Il successo dovrebbe consentire agli scienziati di studiare il modo in cui le proteine evolvono e capire perché la natura "sceglie" determinati ripiegamenti delle proteine e non altri.
La capacità di simulare e progettare proteine artificiali, sostiene il principale autore dello studio, David Baker dell'Università di Washington, apre inoltre la strada verso lo sviluppo di enzimi artificiali da usare come farmaci o catalizzatori industriali.

Baker e i colleghi Brian Kuhlman e Gautam Dantas hanno pubblicato il proprio studio sul numero del 21 novembre della rivista "Science".
Le proteine vengono sintetizzate inizialmente come lunghe catene di aminoacidi e non funzionano in modo appropriato fino a quando non si ripiegano in strutture molto complicate. Comprendere e prevedere le regole che governano questo processo di ripiegamento rappresenta uno dei problemi fondamentali della biologia.
Secondo Baker, la capacità di stabilire la struttura di ripiegamento desiderata per una proteina e poi di crearla offrirebbe enormi benefici scientifici e pratici. "Innanzitutto, - spiega - si tratta di un test indicativo della nostra attuale comprensione delle forze e dell'energetica dei sistemi macromolecolari. In secondo luogo, se si possono progettare strutture completamente nuove, potenzialmente si potrebbero creare nuove macchine molecolari, proteine che svolgono nuove funzioni, come terapeutici, catalizzatori, e così via. Infine, c'è da rispondere alla questione se tutte le strutture che si trovano in natura costituiscono un limite a ciò che è possibile, o se ne esistono anche altre".

Fonte: (27/11/2003)
Pubblicato in Biochimica e Biologia Cellulare

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