Rivisti numero geni minimi per la sopravvivenza di un batterio

Mycobacterium, batteri della tubercolosi

Nei metodi tradizionali non vengono considerati i meccanismi di compensazione attuati in caso di silenziamento di un gene

Quanti geni occorrono per sopravvivere? Nel caso dei batteri almeno il doppio di quanto ritenuto finora. In un articolo sulla rivista “Nature”, i ricercatori del Laboratorio europeo di biologia molecolare di Heidelberg, in Germania, dell’Università di Oxford e di Bath, in Gran Bretagna, e dell’Università Semmelweis di Budapest, in Ungheria, hanno fatto i conti utilizzando un approccio diverso.
Tradizionalmente i biologi stimano il minimo genoma sufficiente a mantenere in vita il batterio rimuovendo o silenziando singoli geni e verificando che questa modifica abbia effetti sulla sopravvivenza dell’organismo.

Se però si considera una prospettiva più ampia che tenga conto della storia evolutiva dell’organismo nonché della sua interazione con l’ambiente circostante, occorre concludere che tale approccio conduce a una sottostima del numero di geni necessari alla sopravvivenza.
“Questo approccio che sfrutta il silenziamento – ha spiegato Laurence Hurst, docente del Dipartimento di biologia e biochimica dell’Università di Bath – non considera il fatto che esistono altri cammini genetici che conducono allo stesso prodotto cellulare: quando si silenzia un gene, il genoma può compensare tale deficit utilizzando un gene alternativo. Se poi si silenzia quest’ultimo, avverrà un’altra compensazione. Mettendo le cose insieme, si arriva a concludere che entrambi i geni sono superflui. In definitiva, tenendo conto dei cammini genetici alternativi, il genoma minimo raddoppia le sue dimensioni.”

Fonte: (30/03/2006)
Pubblicato in Genetica, Biologia Molecolare e Microbiologia

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