Immunoprecipitazione di proteine

Descrizione

La tecnica consente di isolare una specifica proteina per eseguire un western blot. Per ottimizzare la procedura, è bene utilizzare due diversi cloni anticorpali: uno servirà per la reazione di immunoprecipitazione, l'altro, invece, per il blotting.
Tutti i passaggi devono essere eseguiti a 4°C

  • Si parte da un pellet cellulare, ottenuto a seconda delle condizioni di crescita delle proprie cellule. Per cellule cresciute in aderenza, si esegue lo scraping in PBS e la centrifugazione a 2000 rpm a 4°C



  • Aggiungere al pellet in eppendorf il buffer di lisi addizionato con gli inibitori delle proteasi. La quantità di buffer di lisi da aggiungere dipende dal volume del pellet
    Consiglio
    in genere è sufficiente aggiungere un volume di buffer tre volte superiore al volume del pellet




  • Lasciare i campioni in agitazione per 30' in camera fredda



  • Centrifugare per 10' a 14000 rpm in centrifuga refrigerata



  • Raccogliere il surnatante (estratto) in eppendorf pulite e scartare il pellet.



  • Prelevare una quantità di estratto sufficiente ad eseguire il dosaggio delle proteine e normalizzare



  • Incubare l'estratto con l'anticorpo specifico per immunoprecipitare. Le quantità di anticorpo da utilizzare sono descritte nel data-sheet, in genere si utilizzano 1,5 ug di anticorpo/mg di proteine.



  • Far procedere l'incubazione O.N. in camera fredda ed in agitazione



  • Il giorno seguente, aggiungete 30 ug secchi di proteina A/G plus Agarose ad ogni campione



  • Far procedere la reazione per 1,5-2 ore, in camera fredda ed in agitazione



  • Allo scadere delle 2 ore, centrifugare a 14000 rpm



  • Eliminare il surnatante, facendo attenzione a non aspirare la resina



  • Lavare 3 volte la resina con 500 ul di buffer di lisi. ad ogni lavaggio, centrifugare e scartare il surnatante



  • Al termine dei lavaggi e dell'ultima centrifugazione, aggiungere 30 ul di Laemli Sample Buffer



  • Bucare il tappo dell'eppendorf con un ago e bollire i campioni per 5'
    Consiglio
    agitare di tanto in tanto i campioni




  • Centrifugare per 5' a 14000 rpm. raccogliere il surnatante e trasferire in eppendorf pulita, avendo cura di non prelevare anche la resina




  • Eseguire il Western Blot