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jade.87
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 Inserito il - 20 settembre 2009 : 14:39:04
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Ciao a tutti, ho un po di problemi con delle domande di biochimica e ho l'esame tra pochi giorni.. spero che qualcuno sappia darmi una dritta.. grazie a tutti.
1) Glicogeno: via catabolica a produrre glucosio con reazioni delle via.
2) scrivere un peptide con 3 amminoacidi, uno con 4, uno con 6.
3) indicare nei peptidi i gruppi ionizzabili e indicare lo stato di ionizzazione in funzione del pH.
4)Calcolare la Keq della reazioni di idrolisi dell'ATP a dare AMP+PPi.
5)calcolare la Keq della rezione:
Fruttosio-6-P + ATP --> fruttosio-1,6-P + ADP
In base ai seguenti dati:
ATP + H2O ---> ADP + Pi con deltaG°'= -30,5 kj/mole
futtosio-1,6-P + H2O --> fruttosio-6-P + Pi con deltaG°'=16 kj/mole
6) disegnare il peptide ala-glu-gly-tyr a ph 7 ed evidenziare il legame peptidico e descriverne le proprietà.
7) nell'equazione di Michaelis-Menten la V della reazione dipende dalle concentrazioni dell'enzima? Come?
Anche in breve, giusto x avere un idea... Grazie a tutti!
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
 Inserito il - 20 settembre 2009 : 14:42:48
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Citazione:
Messaggio inserito da jade.87
2) scrivere un peptide con 3 amminoacidi, uno con 4, uno con 6.
Anche in breve, giusto x avere un idea... Grazie a tutti!
Almeno su questa non dovresti avere dubbi... |
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 14:56:52
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Citazione:
Messaggio inserito da jade.87
5)calcolare la Keq della rezione:
Fruttosio-6-P + ATP --> fruttosio-1,6-P + ADP
In base ai seguenti dati:
ATP + H2O ---> ADP + Pi con deltaG°'= -30,5 kj/mole
futtosio-1,6-P + H2O --> fruttosio-6-P + Pi con deltaG°'=16 kj/mole
Ad occhio il secondo dG è di segno opposto.
Ora, le due sono reazioni accoppiate, ossia che presentano un composto in comune, dunque puoi sommare i dG delle due equazioni, ricordando però che riscrivendole nel verso dell'equazione il segno del dG cambia. Per es. se A ---> B dG = 3 kj/mol, allora B ---> A dg = -3 kj/mol.
Dunque una volta trovato il dG della reazione sai che
#8710;G = #8710;G° + RT*Ln(Keq)
Con la formula inversa, ponendo #8710;G = 0, trovi la Keq, costante d'equilibrio |
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Pasquale88
Nuovo Arrivato
26 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 15:00:43
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T I RISPONDO SOLO AD ALCUNE DOMANDE DOVE SONO PIù SICURO
1) PER QUANTO RIGUARDA LA GLICOGENO LISI QUESTO è UN PROCESSO IN CUI IL POLIMERO GLICIDICO VIENE SCISSO IN RELAZIONE AD ALCUNE FUNZIONI FISIOLOGICHE (VEDI RILASCIO GLUCAGONE VEDI ADRENALINA)MA CHE COSA ACCADE? DI FONDAMENTALE IMPORTANZA IN QUESTO PROCESSO VI è LA GLICOGENO FOSFORILASI KE PROVVEDE A CATALIZZARE UNA REAZIONE DI FOSFORILAZIONE (KE QUINDI è BEN DIVERSA DA UNA SEMPLICE ROTTURA DI LEGAME GLICOSIDICA) A LIVELLO DELL'ESTREMITà NON RIDUCENTE DEL POLIMERO DI QUESTO ENZIMA ESITONO 2 ISOFORME UNA A(PIù ATTIVA NELLA GLICOGENO LISI) E UNA B(MENO ATTIVA NELLA GLICOGENOLISI) ACCADE CHE ORMONI DI CUI SOPRA PROVVEDONO AD ATTIVARE UN SECONDO MESSA IL cAMP CHE ATTIVA LA PKA LA QUALE è IN GRADO DI CONVERTIRE LA FOSFORILASI B IN A (FOSFORILANDOLA) E ATTIVARE IL PROCESSO A LIVELLO DELLA CATENA LINEARE COME BEN SAI Xò IL GLICOGENO POSSIEDE ANCHE PORZIONI RAMIFICATE E ALLORA LA FOSFORILASI NEI PRESSI DEI 4 RESIDUI GLICIDICI NEI PRESSI DELLA RAMIFICAZIONE E ATTIVA UN ENZIMA DERAMIFICANTE KE RIMUOVE LA RAMIFICAZIONE LIBERANDO GLUCOSIO E PERMETTENDO NUOVAMENTE ALLA FOSFORILASI DI CONTINUARE.dURANTE IL SUO LAVORO LA FOSFORILASI RILASCI GLUCOSIO UNO FOSFOTATO IL QUALE TRAMITE UNA MUTASI VIENE CONVERTITO IN GLUCOSIO 6 P E TRAMITE UNA GLUCOSIO 6FOSFATASI CONVERTITO IN GLUCOSIO.
7)NELLA EQUAZIONE DI M-M L'ENZIMA COMPARE CAMUFFATO NELLA VOCE Vmax ESSA INFATTI è RAPPRESENTATIVA DELL'ENZIMA TANTO CHE CHE è CALCOLABILE V=Kcat* [enzima tot] la conc di enz tot ricordo che per una reazione del tipo E+Sfreccia antiparallela a dare ES --->P+E si calcola sommando la conc di enzima più quella del complesso ES è dunque naturale che concentrazioni enzimatiche elevate influiscano sulla V di reaz
Questo è quanto a presto |
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Pasquale88
Nuovo Arrivato
26 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 15:01:52
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kiedo scusa x i glicidico ma è glucidico
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jade.87
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20 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 15:14:05
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Obarra 1: Almeno su questa non dovresti avere dubbi...
Se non avevo dubbi non l'avrei messa..
Comunque grazie per le risposte, almeno qualche dubbio me lo sono levata!!! |
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0barra1
Utente Senior
Città: Paris, VIIème arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 15:43:26
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non sai disegnare un dipeptide? aggiungi un altro aa e avrai un tripeptide.
Non sai farlo? Cerca su google la sequenza di una proteina a caso, ricopia i primi due aa e l'ultimo e avrai il tuo tripeptide.
Oppure spiegami qual è la difficoltà nel farlo e ci arriviamo insieme a disegnarlo. |
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chick80
Moderatore
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jade.87
Nuovo Arrivato
20 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 16:24:48
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Ad esempio, se mi chiedono di disegnare il tripeptide: try-his-arg, io so che:
try: his: arg:
COO- COO- COO-
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H3N+ - C - H H3N+ - C - H H3N+ - C - H
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CH2 CH2 CH2
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C HC = C CH2
/ \ / \ |
C C H+N NH (pentagono) CH2
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C C C NH
\ / (esagono) H |
C C
| // \
OH H2+N NH2
A questo punto cosa devo fare?  Grazie mille |
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jade.87
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Inserito il - 20 settembre 2009 : 16:29:18
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ops.. è venuto un pasticcio!!!
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
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jade.87
Nuovo Arrivato
20 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 21:25:04
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si si l'ho visto ora!! E' esattamente quello che mi serviva! Grazie mille!!! |
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jade.87
Nuovo Arrivato
20 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 22:24:41
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Quindi se devo disegnare ala-glu-gly-tyr ed evidenziarne i legami è così?
H O O O
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COOH--C--NH--C --C--NH--C--C--NH--C--C--NH2 | | | |
CH3 CH2 H CH2
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CH2 esagono
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COOH OH
Così è giusto? E una volta fatto questo se all'esame mi dovessero chiedere quali sono i gruppi ionizzabili ed indicare lo stato di ionizzazione in funzione del ph cosa dovrei fare??
Ps. Speriamo di aver fatto bene con tag code! |
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jade.87
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Inserito il - 20 settembre 2009 : 22:26:52
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perchè mi è venuto ancora tutto appicciacato!!! |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 20 settembre 2009 : 23:22:57
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Citazione:
Così è giusto? E una volta fatto questo se all'esame mi dovessero chiedere quali sono i gruppi ionizzabili ed indicare lo stato di ionizzazione in funzione del ph cosa dovrei fare??
Sì, è corretto.
Per la ionizzazione in funzione del pH vedi la discussione di sopra, dove è spiegato in maniera estensiva. |
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jade.87
Nuovo Arrivato
20 Messaggi |
Inserito il - 21 settembre 2009 : 13:11:01
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[citazione] Guarda ad es. qui (si parlava di altro, ma ti fa vedere come disegnare un tripeptide): http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=4778 [/citazione]
qui intendi???
Comunque mi servirebbero ancora 2 cosine.. spero possiate aiutarmi!!!
1) Calcolare la Keq della reazione:
fruttosio-6-P + ATP --> fruttosio-1,6-P + ADP
Sapendo che:
ATP + H20 --> ADP + Pi con deltaG°' = -30,5 kj/mole
fruttosio-1,6-P + H20 --> fruttosio-6-P + Pi con deltaG°'= -16 kj/mole
Allora:
deltaG°= -30,5 - (-16)= - 14,5 kj/mole
deltaG=deltaG°+RT ln (Keq)
Pongo poi deltaG=0 --------------> 0=-14,5 + RT ln (Keq) ------> 14,5 = RT ln (Keq)
A questo punto come calcolo la Keq??
2) Calcolare Keq della reazione:
ATP ----> AMP + Pi
Come faccio senza nessun dato??
Grazie in anticipo a tutti!
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gra
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Inserito il - 21 settembre 2009 : 14:54:05
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1) Per R sono sicura, è una costante (mi sembra che valga 8.314 J/(mol K)) mentre x T penso che tu debba considerare la T standard di 25°C= 298 K .
poi risolvi il logaritmo e trovi Keq.
2) sei sicuro di aver scritto giusto? perchè secondo me(non vorrei sbagliarmi, però) dovrebbe essere:
ATP--> ADP + Pi oppure ATP --> AMP+PPi
nel primo caso delta G°' vale -30.5 kJ/mol e nel secondo -32.2 kJ/mol.
Poi la risolvi come quella sopra..
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