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o.maggie
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 11:05:10
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Qulcuno potrebbe aiutarmi nello avolgimento di questo esercizio? grazieeeeeeeeeeeeeeeee
"In Drosophila gli alleli b,wx e cn conferiscono caratteri specifici; B,WX e CN sono i fenotipi selvatici. la mappa è b-cn-wx. la distanza tra b e cn è 10.3 u.m. mentre tra cn e wx è 14.3 u.m. Incrociate una femm selvatica, eterozigote cis con un masch triplo recessivo. Assumendo un interferenza uguale a 0,274 QUANTA e QUALE tipo di progenie si ottiene?"
Parto dall'incrocio: BCNWX/bcnwx x bcnwx/Y
Quindi la progenie dovrebbe essere: BCNWX/bcnwx bcnwx/bcnwx BCNWX/Y bcnwx/Y
Per calcolare le percentuali invece parto dai dati che ho... Calcolo la coincidenza: 1-0,274=0,726 Da questa poi io parto dalla formula: coincidenza=frequenza doppi ricombinanti osservati/attesi é giusto???? svolgendola mi ritrovo a fare: 0,726=x/(0,103 x 0,143) x=1,068
qualcuno mi sa dire se fin qui l'esercizio è affrontato in modo corretto e come posso arrivare da questo dato alle percentuali della progenie? grazieee
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GFPina
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 12:55:49
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No mi spiace è completamente sbagliato!
Prima di tutto da nessuna parte nell'esercizio c'è scritto che sono caratteri associati all'X quindi perchè li hai considerati tali? Sono caratteri AUTOSOMICI (per la precisione stanno sul cromosoma 2, ma questo non c'è nell'esercizio), quindi prova a rifare l'esercizio considerandoli autosomici.
Secondo la progenie che hai scritto sono solo i parentali, e tutti i ricombinanti???
Terzo come dici:
Citazione: Messaggio inserito da o.maggie
Da questa poi io parto dalla formula: coincidenza=frequenza doppi ricombinanti osservati/attesi é giusto????
si questo sarebbe giusto, ma devi calcolarti i doppi ricombinanti "attesi", cosa che non hai fatto.
Come ti ho già consigliato leggiti altri post con questi esercizi, sopratutto questo: Problema: il sig spock e le distanze di mappa dove è spiegato almeno come risolvere la prima parte dell'esercizio, a parte l'interferenza. E per l'interferenza queste ad es. 2 discussioni: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=6649#34276 http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=13208#62376
P.S. sarebbe meglio continuare nello stesso topic che hai aperto, non aprirne uno nuovo con lo stesso esercizio, comunque no problem elimino quello vecchio. |
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GFPina
Moderatore
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 14:40:06
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Piccola correzione a quello che ho scritto, in realtà la frequenza dei doppi ricombinanti attesi l'hai calcolata (sarebbe 0,103 x 0,143):
Citazione: Messaggio inserito da o.maggie
svolgendola mi ritrovo a fare: 0,726=x/(0,103 x 0,143) x=1,068
e quella che ottieni è la frequenza dei doppi ricombinanti osservati. Però i conti sono sbagliati! N.B. una frequenza non può mai essere maggiore di 1 perchè 1 corrisponde al 100%. 1,068 sarebbe 106,8% di DR, ovviamente non può essere.
Poi per calcolarti tutte le altre frequenze procedi esattamente come spiegato nell'altro esercizio, considerano la frequenza dei DR "osservati" che hai calcolato. |
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o.maggie
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 14:42:57
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Grazie... allora, riprovando... da cosa capisco se sono autosomici o legati all'X? deve essere sempre specificato nel testo dell'esercizio? forse mi son fatta confondere dal fatto di incrociare una femm cis con un maschio triplo recessivo....
Quindi dovrei fare l'incrocio di BCNWX/bcnwx x bcnwx/bcnwx
Poi uso solo il fenotipo per la progenie, e quindi ho: BCNWX bcnwx bCNWX Bcnwx bCNwx BcnWX bcnWX BCNwx |
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o.maggie
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 14:49:52
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Per quanto riguarda la frequenza degli attesi l'avevo già inserita nella formula...sarebbe = 1,472 ma da questa come ricavo le varie percentuali di tutta la progenie?? da attesi e osservati ho sempre calcolato facilmente la coincidenza e l'interferenza ma al contrario non riesco proprio ad uscirne poichè non ho nussun riferimento neppure dal mio libro... se riesci a spiegarmi..grazie |
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GFPina
Moderatore
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 14:58:11
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Citazione: Messaggio inserito da o.maggie
da cosa capisco se sono autosomici o legati all'X? deve essere sempre specificato nel testo dell'esercizio?
Si in genere se sono legati all'X è specificato nell'esercizio, oppure il contrario sono esercizi che ti indicano diverse percentuali di progenie maschile e femminile e devi saper dire se è legato all'X. In ogni caso nota che se consideri solo i fenotipi come hai fatto giustamente ora:
Citazione: Messaggio inserito da o.maggie
BCNWX bcnwx bCNWX Bcnwx bCNwx BcnWX bcnWX BCNwx
sarebbero gli stessi anche se fossero caratteri X-linked.
Ora devi dire quali sono Parentali, quali i ricombinanti e quali i DR e mettere le frequenze, puoi anche provare a calcolarle senza interferenza e poi con l'interferenza.
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GFPina
Moderatore
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 15:03:03
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Citazione: Messaggio inserito da o.maggie
Per quanto riguarda la frequenza degli attesi l'avevo già inserita nella formula...sarebbe = 1,472 ma da questa come ricavo le varie percentuali di tutta la progenie?? da attesi e osservati ho sempre calcolato facilmente la coincidenza e l'interferenza ma al contrario non riesco proprio ad uscirne poichè non ho nussun riferimento neppure dal mio libro... se riesci a spiegarmi..grazie
Forse ti sei persa la mia risposta di prima (la seconda risposta) 1,472 non è una frequenza! Rifai i conti e guarda l'esercizio che ti ho likato più volte, li trovi il riferimento spiegato per filo e per segno! Precisamente in questa mia risposta: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=4600#23473
Una volta che hai calcolato la frequenza dei doppi ricombinanti osservati (giusta!), non fai altro che calcolarti le altre frequenze esattamente come spiegato nel link.
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o.maggie
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 15:03:29
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Si scusa, ho rifatto i calcoli... quindi: coincidenza = 0,726 freq.attesi=0,014 freq.osservati=0,010 ma anche leggendo gli esercizi di cui mi hai messo il link non capisco come da questi dati posso calcolare la percentuale della progenie... |
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o.maggie
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 15:19:14
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GRAZIEE ho trovato quello che intendevi... tu hai già fatto i calcoli? risulta che i parentali sono 35,4% e 35,4%???
Ma con questo sistema io l'interferenza che mi da il testo non la uso... C'è un altro modo usandola o è un trabocchetto??? |
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GFPina
Moderatore
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 15:21:59
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Citazione: Messaggio inserito da o.maggie
Si scusa, ho rifatto i calcoli... quindi: coincidenza = 0,726 freq.attesi=0,014 freq.osservati=0,010
A parte l'imprecisione nei calcoli, sarebbe: freq.attesi=0,0147 approssimato 0,015 freq.osservati=0,0107 approssimato 0,011
Citazione: Messaggio inserito da o.maggie
ma anche leggendo gli esercizi di cui mi hai messo il link non capisco come da questi dati posso calcolare la percentuale della progenie...
Prendi esattamente quello che ho scritto e lo sostituisci con i numeri che hai tu!
Citazione: Messaggio inserito da GFPina
tu hai
P A R
__________________________________
p 15 u.m. a 20 u.m. r
diventa: tu hai
B CN WX
__________________________________
b 10,3 u.m. cn 14,3 u.m. wx
Citazione: Messaggio inserito da GFPina
Dalle unità di mappa risali alla frequenza di ricombinazione:
Tra P e A hai 15 u.m. = 15% di ricombinazione Tra A e R hai 20 u.m. = 20% di ricombinazione Doppia ricombinazione 15% x 20%= 3%
diventa: Dalle unità di mappa risali alla frequenza di ricombinazione:
Tra B e CN hai 10,3 u.m. = 10,3% di ricombinazione (o 0,103) Tra CN e WX hai 14,3 u.m. = 14,3% di ricombinazione (o 0,143) Doppia ricombinazione 10,3% x 14,3%= 1,473% (o 0,0147)
Qua devi considerare che hai interferenza quindi abbiamo detto che come frequenza dei doppi ricombinanti devi utilizzare quella osservata, quindi: 0,011
Citazione: Messaggio inserito da GFPina
Passiamo ai ricombinanti dalla 1° ricombinazione: 15% di ricombinazione (ma in questi sono compresi anche i doppi ricombinanti che devo sottrarre) quindi ho: 15%-3%= 12% quindi 6% Par e 6% pAR
diventa: Passiamo ai ricombinanti dalla 1° ricombinazione: 0,103 di ricombinazione (ma in questi sono compresi anche i doppi ricombinanti che devo sottrarre) quindi ho: 0,103-0,011= 0,092 quindi 0,046 Bcnwx e 0,046 bCNWX ... eccetera...
EDIT: beh all'ultima domanda che scrivevi mentre inserivo questo post, ho già risposto qua. |
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o.maggie
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 15:30:21
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scriviamo sempre contemporaneamente e questa discussione è tutta un malinteso comunque ora dovrei aver capito... avedo calcolato gia la frequenza osservata, grazie all'intreferenza... i dppi ricombinanti saranno0,55% e 0,55% mentre dalla 1' e 2' ricombinazione invece che sottrarre l'1,47% sottraggo 1,1% giusto?
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GFPina
Moderatore
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Inserito il - 19 ottobre 2009 : 15:39:19
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Si adesso è giusto, comunque siccome ora devo andare, ti lascio i risultati finali che ti dovrebbero venire, se non ti tornano controlla che non ci siano errori di calcolo:
P 76,47% (38,23% ognuno)
R1 9,23% (4,62% ognuno)
R2 3,23% (6,62% ognuno)
DR 1,07% (0,53% ognuno)
Scusa questi li ho calcolati con una frequenza DR 1,07%, se hai approssimato a 1,1% ti devono venire questi risultati, di poco differenti:
P 76,50% (38,25% ognuno)
R1 9,20% (4,60% ognuno)
R2 13,20% (6,60% ognuno)
DR 1,10% (0,55% ognuno)
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o.maggie
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9 Messaggi |
Inserito il - 19 ottobre 2009 : 15:46:54
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Grazie mille per la pazienza e la chiarezza delle spiegazioni!!!
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