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alelollipop
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2 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2010 : 14:30:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di alelollipop Invia a alelollipop un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ragazzi ho qualche problema con l'algoritmo di needle e wunch....allora da varie ricerche su internet ho visto che bisogna partire da una matrice di sotituzione e da lì calcolare il punteggio in base alle casella possibili in base anche alla regola di apertura di un gap, ma sulle slide del mio prof porta l'esempio di una calcolata in base ad una matrice di identità 0 ed 1 mi date qualche dritta a riguardo?!!il link è questo:http://www.federica.unina.it/scienze-biotecnologiche/biotecnologie-cellulari-e-molecolari/algoritmi-dinamici-di-allineamento/

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1723 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2010 : 21:18:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao alelollipop e benvenuto/a sul forum.
Se non l'hai ancora fatto ti invito a leggere il regolamento.
http://www.molecularlab.it/forum/faq.asp
In particolare:
Citazione:
8) Il forum possiede una funzione "Cerca", ottima per cercate possibili topic (anche vecchi) che contengano già le risposte alle vostre domande.

L'argomento è stato trattato diverse volte...in particolare qualche giorno fa:
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=16585
(evidentemente il prof. Paolella deve aver spiegato l'argomento di recente
)
La matrice di identità (0 e 1) è usate per i nucleotidi, perchè i nucleotidi sono tutti diversi tra loro. La matrice di sostituzione invece ha più senso fra gli amminoacidi, perchè ci sono amminoacidi più simili tra loro e altri più diversi...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2010 : 00:00:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ehm forse perchè appunto è: "Needleman e Wunsch", non "Needle e Wunch"
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domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1723 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2010 : 10:31:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ops...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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