Needle e Wunch

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Autore

Discussione

alelollipop
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2010 : 14:30:35

ragazzi ho qualche problema con l'algoritmo di needle e wunch....allora da varie ricerche su internet ho visto che bisogna partire da una matrice di sotituzione e da l� calcolare il punteggio in base alle casella possibili in base anche alla regola di apertura di un gap, ma sulle slide del mio prof porta l'esempio di una calcolata in base ad una matrice di identit� 0 ed 1 mi date qualche dritta a riguardo?!!il link � questo:http://www.federica.unina.it/scienze-biotecnologiche/biotecnologie-cellulari-e-molecolari/algoritmi-dinamici-di-allineamento/

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2010 : 21:18:03

Ciao alelollipop e benvenuto/a sul forum.
Se non l'hai ancora fatto ti invito a leggere il regolamento.
http://www.molecularlab.it/forum/faq.asp
In particolare:

Citazione:
8) Il forum possiede una funzione "Cerca", ottima per cercate possibili topic (anche vecchi) che contengano gi� le risposte alle vostre domande.

L'argomento � stato trattato diverse volte...in particolare qualche giorno fa:
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=16585
(evidentemente il prof. Paolella deve aver spiegato l'argomento di recente

)
La matrice di identit� (0 e 1) � usate per i nucleotidi, perch� i nucleotidi sono tutti diversi tra loro. La matrice di sostituzione invece ha pi� senso fra gli amminoacidi, perch� ci sono amminoacidi pi� simili tra loro e altri pi� diversi...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

GFPina
Moderatore

Citt�: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2010 : 00:00:49

Ehm forse perch� appunto �: "Needleman e Wunsch", non "Needle e Wunch"