Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 Laboratorio
 Bioinformatica e Biostatistica
 test t indipendent parametrico o non???
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

lucaslennonluca
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 16 maggio 2012 : 14:39:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lucaslennonluca Invia a lucaslennonluca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti ho un dubbio che mi attanaglia e proprio non riesco a capirci nulla!!!Premetto che sto usando Spss.
Espongo il problema sperando che qualcuno possa aiutarmi e ne sarei realmente riconoscente:
devo valutare gli effetti di 3 mesi di 2 diete (1 control ed 1 test) sulla popolazione di due diverse città europee( infatti al momento non sono in Italia!). per ora mi sto limitando a confrontare i gruppi test e control della stessa città. Dopo aver usato la funzione di spss "Dati---> Dividi---> Città e Trattamento" (e quindi aver diviso i dati per città e trattamento), ho fatto un test di normalità per molti dati da confrontare e ho notato che per la maggior parte delle variabili la distribuzione non era normale; così essendo secondo il mio modesto parere poco elegante presentare questi dati con una trasformazione logaritmica per cercare di "normalizzarli",ed essendo inoltre impossibile per alcuni di essi in quanto mi trovo anche variabili negative (nel caso di valori Delta!!!) ho optato per il test non parametrico di Mann-Whitney...sto per caso commettendo un errore???
P.S. Ogni gruppo (4 in totale quindi) ha circa 30 soggetti (per un totale circa 120 soggetti)e quindi credo che il test di Mann-Whitney sia idoneo per vedere se ci sono differenza tra il gruppo test e control dopo aver diviso per città

Può qualcuno aiutarmi per favore???

kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2012 : 11:29:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La scelta mi sembra adatta, anche credo sia una questione di gusti (TMax non fulminarmi per questo). Io per confrontare due distribuzioni uso di solito il Kolmogorov-Smirnov. In ogni caso questi test servono per confrontare coppie di distribuzioni.

Se le devi confrontare tutte assieme io ti suggerirei di fare un'ANOVA; esistono anche varianti per casi non parametrici. Di seguito un topic dove si e' gia' discusso di questo...

http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=26378

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
Torna all'inizio della Pagina

lucaslennonluca
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2012 : 11:52:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lucaslennonluca Invia a lucaslennonluca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao e grazie mille per la risposta :)anche se il mio problema non è il confronto delle distribuzioni, che faccio con lo Shapiro-Wilk (in quanto il mio campione è di circa 30 pazienti in ogni gruppo, e tale test sembra essere migliore in caso di gruppi fino a 30 campioni); il mio vero problema è nel test da adottare in caso di distribuzione potrei dire "mista" (dove è più frequente una distribuzione non normale)! Volendo quindi paragonare gli effetti ad esempio dell'intake di fibre (espresso come Delta) tra il gruppo Control e il gruppo Test di ogni città (avrò quindi come risultato un valore di p- per la città X e un valore di p- per la città Y dopo aver diviso tutti i dati per città!)è sbagliato usare un test non parametrico e più precisamente in test di Mann-Whitney???

Grazie a chiunque cercherà di aiutarmi...e vi prego vivamente di farlo ahah :(
Torna all'inizio della Pagina

kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2012 : 13:50:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scusa ma ho un po' di confusione da quello che hai postato..

Citazione:
[...] il mio problema non è il confronto delle distribuzioni, che faccio con lo Shapiro-Wilk

ma questo si fa per la verifica di normalita' di una distribuzione. Il KS test si usa anch'esso per la verifica di normalita', ma puo' anche essere adattato per confrontare tra loro due distribuzioni non normali.

Citazione:
[...]Volendo quindi paragonare gli effetti ad esempio dell'intake di fibre (espresso come Delta) tra il gruppo Control e il gruppo Test di ogni città

o_O vuoi paragonare gli effetti senza confrontare le distribuzioni... in che modo???

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
Torna all'inizio della Pagina

lucaslennonluca
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2012 : 14:08:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lucaslennonluca Invia a lucaslennonluca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
no assolutamente!!!mi spiego meglio visto che essendo negato per la statistica avrò fatto un pò di casino:
ho paragonato le distribuzioni facendo il test di Shapiro-Wilk perchè mi hanno detto (e ho trovato riscontro su vari blog) che è il test più indicato per gruppi fino a circa 30 campioni. Dopo tale test mi sono trovato distribuzioni "miste" e quindi per quel che so non posso procedere con test parametrici. A questo punto ho bisogno quindi di un consiglio nell'uso di un test parametrico: credi quindi che il test di Kolmogorov-Smirnov sia più indicato del test di Mann-Whitney???

Grazie mille per il consiglio!;)
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2012 : 14:33:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Concordo sul fatto che lo Shapiro-Wilk sia un test di normalità

Il paper originale
http://www.jstor.org/discover/10.2307/2333709?uid=3738016&uid=2&uid=4&sid=56180979153

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

lucaslennonluca
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2012 : 14:38:25  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lucaslennonluca Invia a lucaslennonluca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
il punto non è sullo Shapiro-Wilk...è dopo!Mann-Whitney o KS per il confronto tra gruppi (30X30 campioni) con distribuzione "mista"???
Torna all'inizio della Pagina

kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2012 : 15:28:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da lucaslennonluca

il punto non è sullo Shapiro-Wilk...è dopo!Mann-Whitney o KS per il confronto tra gruppi (30X30 campioni) con distribuzione "mista"???



E' piu' una questione di fede. Io ho usato KS perche' richiede assunti meno stringenti... a dire il vero mi sono fatto uno scriptino ad hoc, perche' di solito il KS viene implementato nei software come test di normalita'. In ogni caso, visto che stai parlando di due fattori indipendenti (citta' e trattamenti) io ricorrerei alla ANOVA

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
Torna all'inizio della Pagina

TMax
Utente Junior

TMax

Prov.: BG
Città: Capriate


270 Messaggi

Inserito il - 18 maggio 2012 : 16:19:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di TMax Invia a TMax un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
io non mi preoccuperei della normalità dei dati del campione ma della normalità ed eventualmente omogeneità della varianza dei residui del modello lineare che adatti
fai un modello lineare ( che è un modo un pò più moderno di trattare i dati che non l'analisi della varianza) con le tue variabili (città e trattamento) e poi verifica normalità e omoegeneità dei residui se sono sufficientemente adeguati sei a posto.

Torna all'inizio della Pagina

lucaslennonluca
Nuovo Arrivato



7 Messaggi

Inserito il - 19 maggio 2012 : 13:40:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lucaslennonluca Invia a lucaslennonluca un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
TMax grazie mille per la dritta...quindi se ho capito bene in spss splitto il file per città essendo due gruppi totalmente distinti e con diete totalmente diverse e vado a farmi una GLM dove come variabile dipendente metto ad esempio il mio valore di Delta ( inteso come valore a 12 mesi - baseline o come media dei 3 mesi - baseline), come fattore fisso metto la dieta (Control/Test) e come covariata metto l'età dei soggetti ( di questo non sono molto sicuro!). E' giusto secondo te come disegno fattoriale???

Grazie mille davvero ragazzi!
Torna all'inizio della Pagina

TMax
Utente Junior

TMax

Prov.: BG
Città: Capriate


270 Messaggi

Inserito il - 19 maggio 2012 : 22:50:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di TMax Invia a TMax un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No No,
come sarebbe a dire che splitti il file...
la città è un fattore che devi considerare
devi mettere tutto, qualcosa come

Y= M+T+City+Age
lo adatti cosi...senza preoccuparti delle significatività
e guardi i residui del modello...quelli devono essere normali...

poi lavori sulla costruzione del modello
magari aggiungendo anche le variabili di interazione
tipo TrattamentoxAge e TrattamentoxCity
....


Ciao
MAx

Citazione:
Messaggio inserito da lucaslennonluca

TMax grazie mille per la dritta...quindi se ho capito bene in spss splitto il file per città essendo due gruppi totalmente distinti e con diete totalmente diverse e vado a farmi una GLM dove come variabile dipendente metto ad esempio il mio valore di Delta ( inteso come valore a 12 mesi - baseline o come media dei 3 mesi - baseline), come fattore fisso metto la dieta (Control/Test) e come covariata metto l'età dei soggetti ( di questo non sono molto sicuro!). E' giusto secondo te come disegno fattoriale???

Grazie mille davvero ragazzi!

Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina