Forum

Utilità
Cerca nel sito:
Scrivimi Contattaci
Glossario Dizionario
Strumenti per interagire con il sito Tools
Mappa del sito Mappa del sito
I libri
consigliati:

Dizionario di biologia
Dizionario di biologia
Autori Vari

Genetica del comportamento
Genetica del comportamento
Autori Vari

Biologia vegetale
Biologia vegetale
Autori Vari

Altri Libri
Nome Utente:
 Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 Laboratorio
 Tecniche
 Come interpretare il delta delta ct		  Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:
Risorse di Tecniche di Laboratorio: Didattica e Relazioni InsideBlog Siti Scientifici Protocolli Laboratorio Siti Scientifici Ultime notizie

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

livido
Nuovo Arrivato




4 Messaggi
Inserito il - 21 marzo 2008 : 11:58:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di livido Invia a livido un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve
Sono uno studente alle prese con la sua tesi di laurea, premetto che non ho molte nozioni sulla PCR e mi scuso se la domanda potrebbe risultare banale.

Ho un problema nell'interpretazione della delta delta ct.

Semplificando il tutto vi chiedo:

Ho il gene x (non trattato)con un valore delta delta ct = 1
Ho il gene x (trattato) con un valore delta delta ct = 0,30

Considerando questi valori di delta delta ct, quali di questi geni si sarà espresso di più?

Grazie



chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 21 marzo 2008 : 23:19:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Guarda questa discussione, dovrebbe chiarirti le idee

http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=7087

Il DDCt è DCt del campione - DCt del controllo... quindi non capisco come ti faccia a venire 1 nel controllo...

...a meno che quelli non siano già i valori di 2^-ddCt
Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

livido
Nuovo Arrivato




4 Messaggi
Inserito il - 22 marzo 2008 : 10:12:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di livido Invia a livido un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si si!!! Effettivamente quelli che ho riportato sono i valori ricavati dalla 2^ -DDCt.

Il link che mi hai postato lo avevo già letto e mi è stato molto utile anche se non riesco ancora ad orientarmi nell'interpretazione dei dati.
Quindi:
Ho il gene x (non trattato)con un valore 2^ -DDCt= 1
Ho il gene x (trattato) con un valore 2^ -DDCt= 0,30

Il gene x in quale situazione risulta espresso di più?

Grazie e scusate ancora per le banalità ma questo non è proprio il mio campo.
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 22 marzo 2008 : 11:12:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Il gene X in questo caso è più espresso nel controllo.
Questo perchè DDCt = 0 per il controllo (ovviamente) e ~1.7 nel trattato ( log2(0.30) )
Ciò vuol dire che DCt del trattato è > di DCt del controllo.
Siccome il DCt è il Ct del gene X - Ct dello standard interno (es. 18s) questo vuol dire che nel trattato il Ct del gene X è più grande rispetto al controllo (assumendo che i Ct del 18s siano simili).
Siccome il Ct è inversamente correlato alla quantità di gene (meno ce n'è più alto è il Ct perchè ci vogliono più cicli per amplificarlo) vuol dire che nel controllo c'è meno gene X.
Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

livido
Nuovo Arrivato




4 Messaggi
Inserito il - 22 marzo 2008 : 11:25:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di livido Invia a livido un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Il gene X in questo caso è più espresso nel controllo.

Questa frase non contraddice la seguente?
Citazione:
vuol dire che nel controllo c'è meno gene X.
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 22 marzo 2008 : 12:13:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Errore di stampa....

Siccome il Ct è inversamente correlato alla quantità di gene (meno ce n'è più alto è il Ct perchè ci vogliono più cicli per amplificarlo) vuol dire che nel trattato c'è meno gene X.
Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

livido
Nuovo Arrivato




4 Messaggi
Inserito il - 22 marzo 2008 : 12:51:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di livido Invia a livido un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok ora mi è chiaro tutto...

speravo fosse così come hai detto tu!!!

Il gene x dopo il trattamento viene espresso di meno.

Grazie per l'aiuto posso dire che è stato di grande conforto
Continuerò a seguirvi perchè è un sito che considero molto interessante.
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina