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Rappy
Nuovo Arrivato
2 Messaggi |
 Inserito il - 13 maggio 2008 : 09:14:38
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Salve,ho appena scoperto questo forum: veramente interessante!
Ho una domanda da porre, ed essendo nuova vi chiedo scusa se l'argomento e' gia' stato trattato o se la sezione non e' quella corretta.
Vi spiego: lavoro in un laboratorio di citogenetica oncologica; ci siamo imbattuti in un paziente leucemico con una traslocazione che interessa un forte enhancer e un gene che perde per delezione una porzione. Di questo gene si sa poco, ma pare non codifichi nessun RNA messaggero. Ora mi sono chiesta se la delezione a cui va incontro il gene non potrebbe trasformarlo da non codificante a codificante (che la porzione persa contenga un silenziatore?). Ma soprattutto (e qui giustifico l'ambito in cui ho inserito questo messaggio) se esiste un sito internet che sia in grado di ipotizzare la presenza di motivi noti (elix-loop-elix, zinc-finger...) a partire dalla lettura della sequenza nucleotidica, che possa associare tale gene ad un gruppo di oncogeni (visto che il paziente non presenta altre anomali citogenetiche, la traslocazione suddetta dovrebbe essere responsabile della neoplasia).
Grazie e mi scuso se sono stata poco chiara! 
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Ayla
Utente Junior
Cittā: Wageningen
573 Messaggi |
Inserito il - 13 maggio 2008 : 09:40:00
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hm...
beh, sul sito di expasy (http://www.expasy.ch/) trovi molte risorse del genere. Io non sono una grande esperta di bioinformatica, ma dalla sequenza nucleotidica é facile risalire alla possibile proteina (http://www.expasy.ch/tools/#translate) e poi con quella sequenza cercare possibili domini (http://www.expasy.ch/prosite/).
Spero di averti aiutato almeno un po'...
Buona fortuna e benvenuta! |
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atreliu
Amministratore
Prov.: Milano
Cittā: Milano
2484 Messaggi |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 13 maggio 2008 : 12:14:42
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| Si possono fare un po' di cose, ma al momento non ho tempo per scrivere. posso rimandare la risposta a stasera? :) |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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Rappy
Nuovo Arrivato
2 Messaggi |
Inserito il - 13 maggio 2008 : 13:35:14
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Certamente, e grazie per le risposte gia' arrivate!! |
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Discussione |
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Sito che predice la proteina da sequenza dna...
Guide tools online
