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Laboratorio di Bioinformatica
La Bioinformatica e' una disciplina emergente che affronta con metodiche proprie delle Scienze dell'Informazione e Computazionali i problemi della Biologia.
Il settore della bioinformatica è in rapida espansione per svariate ragioni. Innanzi tutto, in seguito alla necessita' preponderante di archiviare l'enorme mole di dati che la moderna ricerca biologica produce grazie al progresso tecnologico recente, occorre creare, gestire e mantenere banche di dati specializzate. Basti considerare tra tutti la rilevanza che il progetto Genoma Umano ha avuto ed ha, anche come interesse per la pubblica opinione in seguito alle possibili ricadute in campo biologico, medico, patologico e bioetico.
Inoltre, accanto all'archiviazione dei dati, diventa fondamentale la possibilità di ricavare informazione in modo automatico dalle banche dati. Molteplici sono gli scopi, tra cui la possibilità di ricostruire le tappe evolutive delle varie specie, incluso l'uomo, e la possibilità di ricavare caratteristiche per le varie biomolecole utili nella progettazione di nuove molecole e farmaci in settori diversi, dall'agro-alimentare a quello farmaceutico. Grazie alla Bioinformatica la ricerca biologica e biotecnologia può essere direzionata e mirata, con notevole riduzione nei costi attuativi.

   
Blog  
InsideBioinfo: Blog di Bioinformatica   Inside Bioinfo: per trovare le ultime novità e riflessioni sulla bioinformatica.
 
Forum  
Forum di Biotecnologie e Scienza   Un punto di incontro, in cui affrontare problemi, discussioni su programmi webtools e molto altro.
 
   
Ricerca Banca Dati
  •  Ricerca in banca dati, Enrez, SRS
Ricerca per sequenza
  •  Ricerca per similaritá BLAST, FASTA
Browser Genomici
  •  I Browsers Genomici: EnsEMBL, Genome Browser
Predizione geni
  •  Predizione di geni:Gensan, Genomescan.
Struttura gene, Espressione e RepeatMasker
  •  Analisi della struttura di un gene mediante confronto    con il trascritto: Spidey.
  •  Verifica dell´espressione di un gene mediante la banca dati EST.
  •  Mascheramento di regioni ripetute: RepeatMasker
Comandi Linux
  •  Telnet e i principali comandi linux
Blast da comando e FormaDB
  •  Un editor di testo per linux: joe
  •  Eseguire un blast da linea di comando: blastall
  •  Indicizzare una banca dati per un blast in locale: formatdb
Analisi proteica da programmi gene finding
  •  Analisi ipotetiche proteine predette da programmi di gene finding

Link consigliati:
Portale di Bionformatica dell'Università degli Studi di Milano-Bicocca

Il materiale didattico qui riportato, che comprende una serie di protocolli per lo svolgimento di esercitazioni pratiche di Bioinformatica, e' quello utilizzato dagli studenti dei corsi di Bioinformatica attivati nella Facoltà di Scienze dell'Università di Milano e allestito dal gruppo di ricerca del prof. Graziano Pesole.


 
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