Citazione:

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Gusev Y. Computational methods for analysis of cellular functions and pathways collectively targeted by differentially expressed microRNA. Methods. 2008 Jan;44(1):61-72. Review. PubMed PMID: 18158134.

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Messaggio inserito da Dimo

per l'applicazione del test esatto di fisher, premesso una frequenza minore di 10, qual è il limite di numerosità di uno dei campione per poter applicare questo nella pratica?
un campione di 155 soggetti non è già troppo elevato?
grazie

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Messaggio inserito da Glubus

Come regola euristica si consiglia il test esatto quando il valore ATTESO (fai attenzione: non quello osservato) in una qualche cella di una tabella 2X2 sia minore di 5 (o 10).
Stefano

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Messaggio inserito da Dimo

per l'applicazione del test esatto di fisher, premesso una frequenza minore di 10, qual è il limite di numerosità di uno dei campione per poter applicare questo nella pratica?
un campione di 155 soggetti non è già troppo elevato?
grazie

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Messaggio inserito da Glubus

Come regola euristica si consiglia il test esatto quando il valore ATTESO (fai attenzione: non quello osservato) in una qualche cella di una tabella 2X2 sia minore di 5 (o 10).

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Messaggio inserito da chick80

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Messaggio inserito da Glubus

Come regola euristica si consiglia il test esatto quando il valore ATTESO (fai attenzione: non quello osservato) in una qualche cella di una tabella 2X2 sia minore di 5 (o 10).

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Mi dai una spiegazione matematica di questa regola? Sinceramente non riesco a comprenderla se non per i sopracitati problemi di durata del calcolo.

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Messaggio inserito da Dimo
in pratica allora, se non c'è una regola matematica, perché si distingue il test chi-quadro (con 1 gdl) dal test di fisher?
in ogni caso la mia domanda di prima è ancora valida :)

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Messaggio inserito da Dimo

io considero sempre ciascuna singola categoria confrontandola con tutte le altre, in modo tale da creare una tabella 2x2 (credo solo su una tabella 2x2 si possa fare un test esatto di fisher o no?)

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Citazione:

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For 2 by 2 cases, p-values are obtained directly using the (central or non-central) hypergeometric distribution. Otherwise, computations are based on a C version of the FORTRAN subroutine FEXACT which implements the network developed by Mehta and Patel (1986) and improved by Clarkson, Fan and Joe (1993). The FORTRAN code can be obtained from <URL: http://www.netlib.org/toms/643>.

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Messaggio inserito da TMax

a parte le questioni tecniche sul test di fisher , non puoi affidarti ad un test statistico per decidere se un trattamento funziona o no!

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Messaggio inserito da TMax

e allora perchè ti preoccupi dei valori di p??

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Citazione:

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Messaggio inserito da TMax

lancia una moneta
se esce Testa allora accetti
se esce Croce allora rifiuti

hai 50% di probabilità di fare la scelta giusta!
:)

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Messaggio inserito da Dimo

dunque l'analisi era già stata svolta prima di me e mi hanno chiesto di controllarla e modificarle per alcuni dettagli
ci sono dei pazienti con delle età
praticamente è stata verificata l'assenza di normalità tra le età dei pazienti con lo shapiro wilk e poi è stato applicato il test di mann whitney credo per vedere se la differenza tra le età possa aver influito sui due tipi di trattamento
dopodiché è stato eseguito il test di fisher per verificare se c'era una diminuzione significativa delle complicazioni
ora mi è sorto un dubbio: su campioni non normali si può utilizzare il mann whitney?

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Citazione:

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Messaggio inserito da Glubus

Scusa Dimo, ti do un consiglio: consulta uno statistico o un'esperto di statistica.
Buona parte di quello che hai fatto appartiene ad una stantìa "liturgia" della analisi dei dati e rivela alcune erronee concezioni al riguardo dei test di ipotesi.
Purtroppo questo è il modo di insegnare la statistica che ancora viene praticato in tante università e, acora peggio, sembra che questo tipo di analisi sia utile per poter pubblicare su una buona parte delle riviste scientifiche.
Perciò non ti offendere. Su questo forum trovi anche altre persone in grado di aiutarti ad affrontare in modo più utile e rigoroso il tuo problema, a patto che tu ce lo voglia spiegare dall'inizio.

Stefano

Citazione:

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Messaggio inserito da Dimo

dunque l'analisi era già stata svolta prima di me e mi hanno chiesto di controllarla e modificarle per alcuni dettagli
ci sono dei pazienti con delle età
praticamente è stata verificata l'assenza di normalità tra le età dei pazienti con lo shapiro wilk e poi è stato applicato il test di mann whitney credo per vedere se la differenza tra le età possa aver influito sui due tipi di trattamento
dopodiché è stato eseguito il test di fisher per verificare se c'era una diminuzione significativa delle complicazioni
ora mi è sorto un dubbio: su campioni non normali si può utilizzare il mann whitney?

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